Protein–RNA interactions for Protein: Q9H1K0

RBSN, Rabenosyn-5, humanhuman

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBSNQ9H1K0 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RBSNQ9H1K0 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RBSNQ9H1K0 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RBSNQ9H1K0 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RBSNQ9H1K0 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RBSNQ9H1K0 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RBSNQ9H1K0 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RBSNQ9H1K0 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RBSNQ9H1K0 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RBSNQ9H1K0 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RBSNQ9H1K0 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RBSNQ9H1K0 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RBSNQ9H1K0 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RBSNQ9H1K0 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RBSNQ9H1K0 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RBSNQ9H1K0 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RBSNQ9H1K0 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RBSNQ9H1K0 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RBSNQ9H1K0 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RBSNQ9H1K0 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RBSNQ9H1K0 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RBSNQ9H1K0 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RBSNQ9H1K0 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RBSNQ9H1K0 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RBSNQ9H1K0 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RBSNQ9H1K0 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RBSNQ9H1K0 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RBSNQ9H1K0 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RBSNQ9H1K0 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RBSNQ9H1K0 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RBSNQ9H1K0 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RBSNQ9H1K0 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RBSNQ9H1K0 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RBSNQ9H1K0 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RBSNQ9H1K0 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RBSNQ9H1K0 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RBSNQ9H1K0 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RBSNQ9H1K0 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RBSNQ9H1K0 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RBSNQ9H1K0 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RBSNQ9H1K0 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RBSNQ9H1K0 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RBSNQ9H1K0 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RBSNQ9H1K0 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RBSNQ9H1K0 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RBSNQ9H1K0 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RBSNQ9H1K0 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RBSNQ9H1K0 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RBSNQ9H1K0 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RBSNQ9H1K0 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RBSNQ9H1K0 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RBSNQ9H1K0 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RBSNQ9H1K0 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RBSNQ9H1K0 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RBSNQ9H1K0 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RBSNQ9H1K0 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RBSNQ9H1K0 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RBSNQ9H1K0 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RBSNQ9H1K0 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RBSNQ9H1K0 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RBSNQ9H1K0 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RBSNQ9H1K0 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RBSNQ9H1K0 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RBSNQ9H1K0 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RBSNQ9H1K0 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RBSNQ9H1K0 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RBSNQ9H1K0 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RBSNQ9H1K0 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RBSNQ9H1K0 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RBSNQ9H1K0 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RBSNQ9H1K0 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RBSNQ9H1K0 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RBSNQ9H1K0 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RBSNQ9H1K0 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RBSNQ9H1K0 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RBSNQ9H1K0 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RBSNQ9H1K0 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBSNQ9H1K0 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBSNQ9H1K0 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBSNQ9H1K0 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBSNQ9H1K0 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBSNQ9H1K0 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBSNQ9H1K0 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RBSNQ9H1K0 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBSNQ9H1K0 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBSNQ9H1K0 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBSNQ9H1K0 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBSNQ9H1K0 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBSNQ9H1K0 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBSNQ9H1K0 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBSNQ9H1K0 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBSNQ9H1K0 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBSNQ9H1K0 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBSNQ9H1K0 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBSNQ9H1K0 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBSNQ9H1K0 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBSNQ9H1K0 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBSNQ9H1K0 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RBSNQ9H1K0 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBSNQ9H1K0 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms