Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXR3

ERVK-6, Endogenous retrovirus group K member 6 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-6Q9BXR3 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERVK-6Q9BXR3 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERVK-6Q9BXR3 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERVK-6Q9BXR3 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERVK-6Q9BXR3 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERVK-6Q9BXR3 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERVK-6Q9BXR3 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVK-6Q9BXR3 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVK-6Q9BXR3 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVK-6Q9BXR3 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVK-6Q9BXR3 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVK-6Q9BXR3 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVK-6Q9BXR3 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVK-6Q9BXR3 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVK-6Q9BXR3 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVK-6Q9BXR3 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVK-6Q9BXR3 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVK-6Q9BXR3 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVK-6Q9BXR3 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVK-6Q9BXR3 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVK-6Q9BXR3 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVK-6Q9BXR3 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVK-6Q9BXR3 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVK-6Q9BXR3 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVK-6Q9BXR3 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVK-6Q9BXR3 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVK-6Q9BXR3 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVK-6Q9BXR3 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVK-6Q9BXR3 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVK-6Q9BXR3 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVK-6Q9BXR3 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVK-6Q9BXR3 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVK-6Q9BXR3 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVK-6Q9BXR3 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVK-6Q9BXR3 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVK-6Q9BXR3 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVK-6Q9BXR3 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVK-6Q9BXR3 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVK-6Q9BXR3 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVK-6Q9BXR3 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVK-6Q9BXR3 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVK-6Q9BXR3 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVK-6Q9BXR3 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVK-6Q9BXR3 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVK-6Q9BXR3 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVK-6Q9BXR3 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVK-6Q9BXR3 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVK-6Q9BXR3 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVK-6Q9BXR3 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVK-6Q9BXR3 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVK-6Q9BXR3 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVK-6Q9BXR3 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVK-6Q9BXR3 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVK-6Q9BXR3 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVK-6Q9BXR3 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVK-6Q9BXR3 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVK-6Q9BXR3 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVK-6Q9BXR3 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVK-6Q9BXR3 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVK-6Q9BXR3 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVK-6Q9BXR3 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVK-6Q9BXR3 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVK-6Q9BXR3 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVK-6Q9BXR3 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVK-6Q9BXR3 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVK-6Q9BXR3 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVK-6Q9BXR3 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVK-6Q9BXR3 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVK-6Q9BXR3 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVK-6Q9BXR3 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVK-6Q9BXR3 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVK-6Q9BXR3 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVK-6Q9BXR3 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVK-6Q9BXR3 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVK-6Q9BXR3 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVK-6Q9BXR3 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVK-6Q9BXR3 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ERVK-6Q9BXR3 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVK-6Q9BXR3 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVK-6Q9BXR3 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVK-6Q9BXR3 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVK-6Q9BXR3 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVK-6Q9BXR3 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVK-6Q9BXR3 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVK-6Q9BXR3 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVK-6Q9BXR3 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVK-6Q9BXR3 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVK-6Q9BXR3 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVK-6Q9BXR3 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVK-6Q9BXR3 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVK-6Q9BXR3 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVK-6Q9BXR3 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVK-6Q9BXR3 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVK-6Q9BXR3 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVK-6Q9BXR3 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVK-6Q9BXR3 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVK-6Q9BXR3 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVK-6Q9BXR3 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVK-6Q9BXR3 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVK-6Q9BXR3 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms