Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRF8

CPPED1, Serine/threonine-protein phosphatase CPPED1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPPED1Q9BRF8 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CPPED1Q9BRF8 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CPPED1Q9BRF8 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CPPED1Q9BRF8 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CPPED1Q9BRF8 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CPPED1Q9BRF8 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CPPED1Q9BRF8 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CPPED1Q9BRF8 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CPPED1Q9BRF8 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CPPED1Q9BRF8 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CPPED1Q9BRF8 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CPPED1Q9BRF8 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CPPED1Q9BRF8 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CPPED1Q9BRF8 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CPPED1Q9BRF8 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CPPED1Q9BRF8 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CPPED1Q9BRF8 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CPPED1Q9BRF8 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CPPED1Q9BRF8 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CPPED1Q9BRF8 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CPPED1Q9BRF8 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CPPED1Q9BRF8 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CPPED1Q9BRF8 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CPPED1Q9BRF8 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CPPED1Q9BRF8 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CPPED1Q9BRF8 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CPPED1Q9BRF8 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CPPED1Q9BRF8 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CPPED1Q9BRF8 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CPPED1Q9BRF8 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CPPED1Q9BRF8 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CPPED1Q9BRF8 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CPPED1Q9BRF8 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CPPED1Q9BRF8 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CPPED1Q9BRF8 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CPPED1Q9BRF8 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CPPED1Q9BRF8 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CPPED1Q9BRF8 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CPPED1Q9BRF8 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CPPED1Q9BRF8 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CPPED1Q9BRF8 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CPPED1Q9BRF8 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CPPED1Q9BRF8 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CPPED1Q9BRF8 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CPPED1Q9BRF8 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CPPED1Q9BRF8 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CPPED1Q9BRF8 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CPPED1Q9BRF8 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CPPED1Q9BRF8 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CPPED1Q9BRF8 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CPPED1Q9BRF8 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CPPED1Q9BRF8 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CPPED1Q9BRF8 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CPPED1Q9BRF8 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CPPED1Q9BRF8 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CPPED1Q9BRF8 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CPPED1Q9BRF8 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CPPED1Q9BRF8 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CPPED1Q9BRF8 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CPPED1Q9BRF8 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CPPED1Q9BRF8 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CPPED1Q9BRF8 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CPPED1Q9BRF8 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CPPED1Q9BRF8 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CPPED1Q9BRF8 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CPPED1Q9BRF8 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CPPED1Q9BRF8 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CPPED1Q9BRF8 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CPPED1Q9BRF8 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CPPED1Q9BRF8 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CPPED1Q9BRF8 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CPPED1Q9BRF8 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CPPED1Q9BRF8 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CPPED1Q9BRF8 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CPPED1Q9BRF8 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CPPED1Q9BRF8 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CPPED1Q9BRF8 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CPPED1Q9BRF8 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CPPED1Q9BRF8 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CPPED1Q9BRF8 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CPPED1Q9BRF8 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CPPED1Q9BRF8 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CPPED1Q9BRF8 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CPPED1Q9BRF8 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CPPED1Q9BRF8 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CPPED1Q9BRF8 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CPPED1Q9BRF8 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CPPED1Q9BRF8 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CPPED1Q9BRF8 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CPPED1Q9BRF8 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CPPED1Q9BRF8 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CPPED1Q9BRF8 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CPPED1Q9BRF8 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CPPED1Q9BRF8 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CPPED1Q9BRF8 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CPPED1Q9BRF8 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CPPED1Q9BRF8 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CPPED1Q9BRF8 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CPPED1Q9BRF8 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CPPED1Q9BRF8 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms