Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR84

ZNF559, Zinc finger protein 559, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF559Q9BR84 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF559Q9BR84 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF559Q9BR84 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF559Q9BR84 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF559Q9BR84 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF559Q9BR84 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF559Q9BR84 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF559Q9BR84 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF559Q9BR84 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF559Q9BR84 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF559Q9BR84 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF559Q9BR84 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF559Q9BR84 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF559Q9BR84 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF559Q9BR84 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF559Q9BR84 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF559Q9BR84 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF559Q9BR84 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF559Q9BR84 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF559Q9BR84 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF559Q9BR84 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF559Q9BR84 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF559Q9BR84 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF559Q9BR84 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF559Q9BR84 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF559Q9BR84 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF559Q9BR84 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF559Q9BR84 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF559Q9BR84 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF559Q9BR84 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF559Q9BR84 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF559Q9BR84 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF559Q9BR84 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF559Q9BR84 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF559Q9BR84 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF559Q9BR84 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF559Q9BR84 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF559Q9BR84 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF559Q9BR84 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF559Q9BR84 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF559Q9BR84 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF559Q9BR84 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF559Q9BR84 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF559Q9BR84 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF559Q9BR84 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF559Q9BR84 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF559Q9BR84 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF559Q9BR84 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF559Q9BR84 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF559Q9BR84 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF559Q9BR84 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF559Q9BR84 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF559Q9BR84 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF559Q9BR84 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF559Q9BR84 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF559Q9BR84 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF559Q9BR84 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF559Q9BR84 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF559Q9BR84 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF559Q9BR84 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF559Q9BR84 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF559Q9BR84 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF559Q9BR84 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF559Q9BR84 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF559Q9BR84 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF559Q9BR84 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF559Q9BR84 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF559Q9BR84 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF559Q9BR84 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF559Q9BR84 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF559Q9BR84 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF559Q9BR84 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF559Q9BR84 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF559Q9BR84 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF559Q9BR84 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF559Q9BR84 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF559Q9BR84 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF559Q9BR84 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF559Q9BR84 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF559Q9BR84 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF559Q9BR84 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF559Q9BR84 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF559Q9BR84 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF559Q9BR84 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF559Q9BR84 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF559Q9BR84 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF559Q9BR84 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF559Q9BR84 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF559Q9BR84 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF559Q9BR84 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF559Q9BR84 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF559Q9BR84 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ZNF559Q9BR84 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
ZNF559Q9BR84 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
ZNF559Q9BR84 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ZNF559Q9BR84 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ZNF559Q9BR84 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF559Q9BR84 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF559Q9BR84 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF559Q9BR84 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.7 ms