Protein–RNA interactions for Protein: Q96G79

SLC35A4, Probable UDP-sugar transporter protein SLC35A4, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35A4Q96G79 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC35A4Q96G79 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC35A4Q96G79 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC35A4Q96G79 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC35A4Q96G79 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC35A4Q96G79 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC35A4Q96G79 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC35A4Q96G79 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC35A4Q96G79 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC35A4Q96G79 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC35A4Q96G79 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC35A4Q96G79 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC35A4Q96G79 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC35A4Q96G79 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC35A4Q96G79 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC35A4Q96G79 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC35A4Q96G79 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC35A4Q96G79 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC35A4Q96G79 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC35A4Q96G79 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC35A4Q96G79 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC35A4Q96G79 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC35A4Q96G79 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC35A4Q96G79 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC35A4Q96G79 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC35A4Q96G79 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC35A4Q96G79 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC35A4Q96G79 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC35A4Q96G79 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC35A4Q96G79 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC35A4Q96G79 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC35A4Q96G79 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC35A4Q96G79 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC35A4Q96G79 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC35A4Q96G79 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC35A4Q96G79 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC35A4Q96G79 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC35A4Q96G79 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC35A4Q96G79 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC35A4Q96G79 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC35A4Q96G79 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC35A4Q96G79 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC35A4Q96G79 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC35A4Q96G79 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC35A4Q96G79 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC35A4Q96G79 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC35A4Q96G79 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC35A4Q96G79 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC35A4Q96G79 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC35A4Q96G79 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC35A4Q96G79 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC35A4Q96G79 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC35A4Q96G79 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC35A4Q96G79 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC35A4Q96G79 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC35A4Q96G79 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC35A4Q96G79 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC35A4Q96G79 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC35A4Q96G79 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC35A4Q96G79 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC35A4Q96G79 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC35A4Q96G79 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC35A4Q96G79 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC35A4Q96G79 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC35A4Q96G79 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC35A4Q96G79 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC35A4Q96G79 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC35A4Q96G79 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC35A4Q96G79 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC35A4Q96G79 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC35A4Q96G79 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC35A4Q96G79 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC35A4Q96G79 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC35A4Q96G79 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC35A4Q96G79 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC35A4Q96G79 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC35A4Q96G79 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC35A4Q96G79 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC35A4Q96G79 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC35A4Q96G79 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC35A4Q96G79 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC35A4Q96G79 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC35A4Q96G79 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC35A4Q96G79 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC35A4Q96G79 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC35A4Q96G79 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC35A4Q96G79 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC35A4Q96G79 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC35A4Q96G79 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SLC35A4Q96G79 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SLC35A4Q96G79 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SLC35A4Q96G79 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SLC35A4Q96G79 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SLC35A4Q96G79 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SLC35A4Q96G79 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC35A4Q96G79 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC35A4Q96G79 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC35A4Q96G79 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC35A4Q96G79 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC35A4Q96G79 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms