Protein–RNA interactions for Protein: Q96EL3

MRPL53, 39S ribosomal protein L53, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL53Q96EL3 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MRPL53Q96EL3 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MRPL53Q96EL3 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MRPL53Q96EL3 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MRPL53Q96EL3 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MRPL53Q96EL3 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MRPL53Q96EL3 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MRPL53Q96EL3 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MRPL53Q96EL3 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MRPL53Q96EL3 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MRPL53Q96EL3 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MRPL53Q96EL3 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
MRPL53Q96EL3 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MRPL53Q96EL3 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
MRPL53Q96EL3 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MRPL53Q96EL3 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MRPL53Q96EL3 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MRPL53Q96EL3 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MRPL53Q96EL3 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MRPL53Q96EL3 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MRPL53Q96EL3 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MRPL53Q96EL3 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MRPL53Q96EL3 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MRPL53Q96EL3 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MRPL53Q96EL3 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MRPL53Q96EL3 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MRPL53Q96EL3 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MRPL53Q96EL3 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MRPL53Q96EL3 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MRPL53Q96EL3 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MRPL53Q96EL3 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MRPL53Q96EL3 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MRPL53Q96EL3 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MRPL53Q96EL3 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MRPL53Q96EL3 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MRPL53Q96EL3 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MRPL53Q96EL3 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MRPL53Q96EL3 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MRPL53Q96EL3 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MRPL53Q96EL3 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MRPL53Q96EL3 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MRPL53Q96EL3 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MRPL53Q96EL3 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
MRPL53Q96EL3 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MRPL53Q96EL3 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MRPL53Q96EL3 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MRPL53Q96EL3 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MRPL53Q96EL3 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MRPL53Q96EL3 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MRPL53Q96EL3 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MRPL53Q96EL3 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
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