Protein–RNA interactions for Protein: Q96D46

NMD3, 60S ribosomal export protein NMD3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMD3Q96D46 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NMD3Q96D46 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NMD3Q96D46 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NMD3Q96D46 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NMD3Q96D46 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NMD3Q96D46 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NMD3Q96D46 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NMD3Q96D46 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NMD3Q96D46 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NMD3Q96D46 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NMD3Q96D46 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NMD3Q96D46 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NMD3Q96D46 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NMD3Q96D46 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NMD3Q96D46 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
NMD3Q96D46 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NMD3Q96D46 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NMD3Q96D46 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NMD3Q96D46 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NMD3Q96D46 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
NMD3Q96D46 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NMD3Q96D46 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NMD3Q96D46 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NMD3Q96D46 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NMD3Q96D46 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NMD3Q96D46 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NMD3Q96D46 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NMD3Q96D46 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NMD3Q96D46 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NMD3Q96D46 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NMD3Q96D46 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NMD3Q96D46 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NMD3Q96D46 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
NMD3Q96D46 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
NMD3Q96D46 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NMD3Q96D46 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NMD3Q96D46 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NMD3Q96D46 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NMD3Q96D46 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NMD3Q96D46 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NMD3Q96D46 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NMD3Q96D46 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NMD3Q96D46 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NMD3Q96D46 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NMD3Q96D46 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NMD3Q96D46 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NMD3Q96D46 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NMD3Q96D46 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NMD3Q96D46 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NMD3Q96D46 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NMD3Q96D46 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NMD3Q96D46 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NMD3Q96D46 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NMD3Q96D46 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NMD3Q96D46 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
NMD3Q96D46 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
NMD3Q96D46 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NMD3Q96D46 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NMD3Q96D46 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NMD3Q96D46 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NMD3Q96D46 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NMD3Q96D46 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NMD3Q96D46 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
NMD3Q96D46 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NMD3Q96D46 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NMD3Q96D46 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NMD3Q96D46 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NMD3Q96D46 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NMD3Q96D46 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NMD3Q96D46 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NMD3Q96D46 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NMD3Q96D46 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NMD3Q96D46 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NMD3Q96D46 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NMD3Q96D46 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NMD3Q96D46 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NMD3Q96D46 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NMD3Q96D46 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NMD3Q96D46 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NMD3Q96D46 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NMD3Q96D46 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NMD3Q96D46 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NMD3Q96D46 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NMD3Q96D46 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NMD3Q96D46 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NMD3Q96D46 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NMD3Q96D46 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NMD3Q96D46 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NMD3Q96D46 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NMD3Q96D46 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NMD3Q96D46 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NMD3Q96D46 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NMD3Q96D46 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NMD3Q96D46 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NMD3Q96D46 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NMD3Q96D46 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NMD3Q96D46 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NMD3Q96D46 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NMD3Q96D46 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NMD3Q96D46 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms