Protein–RNA interactions for Protein: Q8N300

SVBP, Small vasohibin-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 66 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVBPQ8N300 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SVBPQ8N300 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SVBPQ8N300 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SVBPQ8N300 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SVBPQ8N300 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SVBPQ8N300 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SVBPQ8N300 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SVBPQ8N300 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SVBPQ8N300 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SVBPQ8N300 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SVBPQ8N300 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SVBPQ8N300 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SVBPQ8N300 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SVBPQ8N300 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SVBPQ8N300 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SVBPQ8N300 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SVBPQ8N300 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SVBPQ8N300 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SVBPQ8N300 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SVBPQ8N300 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SVBPQ8N300 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SVBPQ8N300 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SVBPQ8N300 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SVBPQ8N300 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SVBPQ8N300 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SVBPQ8N300 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SVBPQ8N300 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SVBPQ8N300 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SVBPQ8N300 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SVBPQ8N300 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SVBPQ8N300 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SVBPQ8N300 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SVBPQ8N300 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SVBPQ8N300 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SVBPQ8N300 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SVBPQ8N300 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SVBPQ8N300 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SVBPQ8N300 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SVBPQ8N300 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SVBPQ8N300 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SVBPQ8N300 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SVBPQ8N300 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SVBPQ8N300 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SVBPQ8N300 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SVBPQ8N300 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SVBPQ8N300 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SVBPQ8N300 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SVBPQ8N300 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SVBPQ8N300 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SVBPQ8N300 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SVBPQ8N300 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SVBPQ8N300 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SVBPQ8N300 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SVBPQ8N300 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SVBPQ8N300 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SVBPQ8N300 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SVBPQ8N300 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SVBPQ8N300 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SVBPQ8N300 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SVBPQ8N300 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SVBPQ8N300 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SVBPQ8N300 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SVBPQ8N300 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SVBPQ8N300 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SVBPQ8N300 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SVBPQ8N300 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SVBPQ8N300 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SVBPQ8N300 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SVBPQ8N300 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SVBPQ8N300 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SVBPQ8N300 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SVBPQ8N300 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SVBPQ8N300 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SVBPQ8N300 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SVBPQ8N300 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SVBPQ8N300 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SVBPQ8N300 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SVBPQ8N300 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SVBPQ8N300 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SVBPQ8N300 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SVBPQ8N300 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SVBPQ8N300 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SVBPQ8N300 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SVBPQ8N300 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SVBPQ8N300 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SVBPQ8N300 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SVBPQ8N300 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SVBPQ8N300 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SVBPQ8N300 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SVBPQ8N300 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SVBPQ8N300 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SVBPQ8N300 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SVBPQ8N300 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SVBPQ8N300 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SVBPQ8N300 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SVBPQ8N300 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SVBPQ8N300 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SVBPQ8N300 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SVBPQ8N300 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SVBPQ8N300 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms