Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW31

SYDE1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYDE1Q6ZW31 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYDE1Q6ZW31 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYDE1Q6ZW31 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYDE1Q6ZW31 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYDE1Q6ZW31 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYDE1Q6ZW31 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYDE1Q6ZW31 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYDE1Q6ZW31 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYDE1Q6ZW31 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYDE1Q6ZW31 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYDE1Q6ZW31 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYDE1Q6ZW31 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYDE1Q6ZW31 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYDE1Q6ZW31 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYDE1Q6ZW31 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYDE1Q6ZW31 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYDE1Q6ZW31 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYDE1Q6ZW31 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SYDE1Q6ZW31 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYDE1Q6ZW31 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYDE1Q6ZW31 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYDE1Q6ZW31 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYDE1Q6ZW31 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYDE1Q6ZW31 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYDE1Q6ZW31 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYDE1Q6ZW31 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYDE1Q6ZW31 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SYDE1Q6ZW31 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SYDE1Q6ZW31 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYDE1Q6ZW31 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYDE1Q6ZW31 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYDE1Q6ZW31 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYDE1Q6ZW31 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYDE1Q6ZW31 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYDE1Q6ZW31 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYDE1Q6ZW31 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYDE1Q6ZW31 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SYDE1Q6ZW31 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYDE1Q6ZW31 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYDE1Q6ZW31 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYDE1Q6ZW31 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYDE1Q6ZW31 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SYDE1Q6ZW31 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYDE1Q6ZW31 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYDE1Q6ZW31 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYDE1Q6ZW31 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYDE1Q6ZW31 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYDE1Q6ZW31 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYDE1Q6ZW31 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYDE1Q6ZW31 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYDE1Q6ZW31 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYDE1Q6ZW31 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYDE1Q6ZW31 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYDE1Q6ZW31 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYDE1Q6ZW31 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYDE1Q6ZW31 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYDE1Q6ZW31 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYDE1Q6ZW31 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYDE1Q6ZW31 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYDE1Q6ZW31 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYDE1Q6ZW31 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYDE1Q6ZW31 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYDE1Q6ZW31 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYDE1Q6ZW31 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYDE1Q6ZW31 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYDE1Q6ZW31 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYDE1Q6ZW31 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYDE1Q6ZW31 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYDE1Q6ZW31 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYDE1Q6ZW31 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYDE1Q6ZW31 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYDE1Q6ZW31 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYDE1Q6ZW31 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYDE1Q6ZW31 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYDE1Q6ZW31 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYDE1Q6ZW31 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYDE1Q6ZW31 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SYDE1Q6ZW31 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYDE1Q6ZW31 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYDE1Q6ZW31 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYDE1Q6ZW31 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYDE1Q6ZW31 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYDE1Q6ZW31 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYDE1Q6ZW31 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SYDE1Q6ZW31 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SYDE1Q6ZW31 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SYDE1Q6ZW31 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYDE1Q6ZW31 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYDE1Q6ZW31 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYDE1Q6ZW31 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYDE1Q6ZW31 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYDE1Q6ZW31 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYDE1Q6ZW31 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYDE1Q6ZW31 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYDE1Q6ZW31 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYDE1Q6ZW31 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYDE1Q6ZW31 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYDE1Q6ZW31 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYDE1Q6ZW31 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYDE1Q6ZW31 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms