Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPR3

TYW3, tRNA wybutosine-synthesizing protein 3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYW3Q6IPR3 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TYW3Q6IPR3 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TYW3Q6IPR3 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TYW3Q6IPR3 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TYW3Q6IPR3 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TYW3Q6IPR3 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TYW3Q6IPR3 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TYW3Q6IPR3 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TYW3Q6IPR3 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TYW3Q6IPR3 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TYW3Q6IPR3 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TYW3Q6IPR3 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TYW3Q6IPR3 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TYW3Q6IPR3 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TYW3Q6IPR3 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TYW3Q6IPR3 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TYW3Q6IPR3 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TYW3Q6IPR3 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TYW3Q6IPR3 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TYW3Q6IPR3 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TYW3Q6IPR3 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TYW3Q6IPR3 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TYW3Q6IPR3 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TYW3Q6IPR3 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TYW3Q6IPR3 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TYW3Q6IPR3 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TYW3Q6IPR3 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TYW3Q6IPR3 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TYW3Q6IPR3 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TYW3Q6IPR3 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TYW3Q6IPR3 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TYW3Q6IPR3 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TYW3Q6IPR3 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TYW3Q6IPR3 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TYW3Q6IPR3 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TYW3Q6IPR3 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TYW3Q6IPR3 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TYW3Q6IPR3 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TYW3Q6IPR3 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TYW3Q6IPR3 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TYW3Q6IPR3 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TYW3Q6IPR3 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TYW3Q6IPR3 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TYW3Q6IPR3 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TYW3Q6IPR3 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TYW3Q6IPR3 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TYW3Q6IPR3 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TYW3Q6IPR3 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TYW3Q6IPR3 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TYW3Q6IPR3 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TYW3Q6IPR3 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TYW3Q6IPR3 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TYW3Q6IPR3 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TYW3Q6IPR3 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TYW3Q6IPR3 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TYW3Q6IPR3 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TYW3Q6IPR3 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TYW3Q6IPR3 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TYW3Q6IPR3 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TYW3Q6IPR3 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TYW3Q6IPR3 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TYW3Q6IPR3 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TYW3Q6IPR3 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TYW3Q6IPR3 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
TYW3Q6IPR3 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TYW3Q6IPR3 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TYW3Q6IPR3 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TYW3Q6IPR3 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TYW3Q6IPR3 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TYW3Q6IPR3 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TYW3Q6IPR3 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TYW3Q6IPR3 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TYW3Q6IPR3 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TYW3Q6IPR3 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TYW3Q6IPR3 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TYW3Q6IPR3 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TYW3Q6IPR3 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TYW3Q6IPR3 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TYW3Q6IPR3 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TYW3Q6IPR3 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TYW3Q6IPR3 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TYW3Q6IPR3 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TYW3Q6IPR3 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TYW3Q6IPR3 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TYW3Q6IPR3 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TYW3Q6IPR3 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TYW3Q6IPR3 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TYW3Q6IPR3 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TYW3Q6IPR3 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TYW3Q6IPR3 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TYW3Q6IPR3 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TYW3Q6IPR3 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TYW3Q6IPR3 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TYW3Q6IPR3 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TYW3Q6IPR3 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TYW3Q6IPR3 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TYW3Q6IPR3 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TYW3Q6IPR3 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TYW3Q6IPR3 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TYW3Q6IPR3 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms