Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
VAMP3Q15836 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
VAMP3Q15836 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
VAMP3Q15836 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
VAMP3Q15836 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
VAMP3Q15836 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
VAMP3Q15836 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
VAMP3Q15836 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
VAMP3Q15836 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
VAMP3Q15836 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
VAMP3Q15836 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
VAMP3Q15836 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
VAMP3Q15836 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
VAMP3Q15836 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
VAMP3Q15836 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
VAMP3Q15836 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
VAMP3Q15836 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
VAMP3Q15836 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
VAMP3Q15836 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
VAMP3Q15836 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
VAMP3Q15836 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
VAMP3Q15836 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
VAMP3Q15836 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
VAMP3Q15836 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
VAMP3Q15836 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
VAMP3Q15836 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
VAMP3Q15836 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
VAMP3Q15836 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
VAMP3Q15836 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
VAMP3Q15836 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.16
VAMP3Q15836 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
VAMP3Q15836 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
VAMP3Q15836 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
VAMP3Q15836 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
VAMP3Q15836 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
VAMP3Q15836 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
VAMP3Q15836 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
VAMP3Q15836 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
VAMP3Q15836 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
VAMP3Q15836 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
VAMP3Q15836 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
VAMP3Q15836 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
VAMP3Q15836 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
VAMP3Q15836 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
VAMP3Q15836 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
VAMP3Q15836 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
VAMP3Q15836 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
VAMP3Q15836 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
VAMP3Q15836 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
VAMP3Q15836 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
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VAMP3Q15836 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
VAMP3Q15836 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
VAMP3Q15836 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
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VAMP3Q15836 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
VAMP3Q15836 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
VAMP3Q15836 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
VAMP3Q15836 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
VAMP3Q15836 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
VAMP3Q15836 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
VAMP3Q15836 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
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VAMP3Q15836 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
VAMP3Q15836 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
VAMP3Q15836 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
VAMP3Q15836 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
VAMP3Q15836 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC14□□□□□ -0.17
VAMP3Q15836 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
VAMP3Q15836 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
VAMP3Q15836 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
VAMP3Q15836 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
VAMP3Q15836 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
VAMP3Q15836 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
VAMP3Q15836 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
VAMP3Q15836 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
VAMP3Q15836 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
VAMP3Q15836 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
VAMP3Q15836 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
VAMP3Q15836 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
VAMP3Q15836 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
VAMP3Q15836 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
VAMP3Q15836 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
VAMP3Q15836 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC14□□□□□ -0.17
VAMP3Q15836 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
VAMP3Q15836 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
VAMP3Q15836 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
VAMP3Q15836 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
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