Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRRQ15256 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRRQ15256 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRRQ15256 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRRQ15256 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRRQ15256 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRRQ15256 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRRQ15256 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRRQ15256 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRRQ15256 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRRQ15256 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRRQ15256 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRRQ15256 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRRQ15256 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRRQ15256 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRRQ15256 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRRQ15256 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRRQ15256 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRRQ15256 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRRQ15256 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRRQ15256 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRRQ15256 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRRQ15256 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRRQ15256 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRRQ15256 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRRQ15256 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRRQ15256 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRRQ15256 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRRQ15256 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRRQ15256 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRRQ15256 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRRQ15256 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRRQ15256 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRRQ15256 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRRQ15256 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRRQ15256 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRRQ15256 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRRQ15256 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRRQ15256 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRRQ15256 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRRQ15256 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRRQ15256 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRRQ15256 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRRQ15256 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRRQ15256 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRRQ15256 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRRQ15256 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRRQ15256 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRRQ15256 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRRQ15256 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRRQ15256 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRRQ15256 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRRQ15256 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRRQ15256 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRRQ15256 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRRQ15256 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRRQ15256 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRRQ15256 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRRQ15256 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRRQ15256 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRRQ15256 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRRQ15256 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRRQ15256 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRRQ15256 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRRQ15256 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRRQ15256 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRRQ15256 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRRQ15256 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRRQ15256 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRRQ15256 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRRQ15256 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRRQ15256 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRRQ15256 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRRQ15256 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRRQ15256 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRRQ15256 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRRQ15256 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRRQ15256 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRRQ15256 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRRQ15256 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRRQ15256 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRRQ15256 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRRQ15256 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRRQ15256 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRRQ15256 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRRQ15256 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRRQ15256 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRRQ15256 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRRQ15256 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRRQ15256 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRRQ15256 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRRQ15256 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRRQ15256 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRRQ15256 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRRQ15256 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRRQ15256 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRRQ15256 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRRQ15256 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRRQ15256 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRRQ15256 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms