Protein–RNA interactions for Protein: Q15120

PDK3, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK3Q15120 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDK3Q15120 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDK3Q15120 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDK3Q15120 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDK3Q15120 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDK3Q15120 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDK3Q15120 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDK3Q15120 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDK3Q15120 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDK3Q15120 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDK3Q15120 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDK3Q15120 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDK3Q15120 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDK3Q15120 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDK3Q15120 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDK3Q15120 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDK3Q15120 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDK3Q15120 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDK3Q15120 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDK3Q15120 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDK3Q15120 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDK3Q15120 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PDK3Q15120 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDK3Q15120 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PDK3Q15120 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDK3Q15120 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDK3Q15120 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDK3Q15120 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDK3Q15120 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDK3Q15120 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDK3Q15120 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDK3Q15120 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PDK3Q15120 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDK3Q15120 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDK3Q15120 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDK3Q15120 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDK3Q15120 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDK3Q15120 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDK3Q15120 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDK3Q15120 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDK3Q15120 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PDK3Q15120 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDK3Q15120 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDK3Q15120 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDK3Q15120 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDK3Q15120 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDK3Q15120 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDK3Q15120 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDK3Q15120 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDK3Q15120 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDK3Q15120 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDK3Q15120 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDK3Q15120 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDK3Q15120 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDK3Q15120 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDK3Q15120 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDK3Q15120 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDK3Q15120 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDK3Q15120 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDK3Q15120 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDK3Q15120 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDK3Q15120 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDK3Q15120 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDK3Q15120 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDK3Q15120 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDK3Q15120 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDK3Q15120 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDK3Q15120 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDK3Q15120 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDK3Q15120 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDK3Q15120 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDK3Q15120 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDK3Q15120 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDK3Q15120 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDK3Q15120 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDK3Q15120 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
PDK3Q15120 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
PDK3Q15120 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDK3Q15120 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PDK3Q15120 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDK3Q15120 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PDK3Q15120 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDK3Q15120 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDK3Q15120 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDK3Q15120 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDK3Q15120 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDK3Q15120 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDK3Q15120 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDK3Q15120 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDK3Q15120 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDK3Q15120 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDK3Q15120 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDK3Q15120 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDK3Q15120 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDK3Q15120 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDK3Q15120 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDK3Q15120 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDK3Q15120 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDK3Q15120 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDK3Q15120 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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