Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.821e-7■■■■□ 21.3
PABPC4Q13310 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.81e-7■■■■□ 21.3
PABPC4Q13310 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.061e-7■■■■□ 21.3
PABPC4Q13310 RPL10-212ENST00000479366 569 ntTSL 416.12■□□□□ 0.173e-15■■■■□ 21.3
PABPC4Q13310 ZC3H18-206ENST00000565583 1068 ntTSL 215.84■□□□□ 0.131e-8■■■■□ 21.3
PABPC4Q13310 ZC3H18-201ENST00000301011 3729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.021e-8■■■■□ 21.3
PABPC4Q13310 ZC3H18-208ENST00000566496 1949 ntTSL 214.2□□□□□ -0.141e-8■■■■□ 21.3
PABPC4Q13310 LRRC75A-AS1-228ENST00000584141 564 ntTSL 222.38■■□□□ 1.175e-38■■■■□ 21.3
PABPC4Q13310 LRRC75A-AS1-219ENST00000578757 920 ntTSL 1 (best)15.69■□□□□ 0.15e-38■■■■□ 21.3
PABPC4Q13310 ARL6IP4-212ENST00000456762 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 220.7■□□□□ 0.98e-7■■■■□ 21.3
PABPC4Q13310 DANCR-205ENST00000623036 748 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.364e-7■■■■□ 21.3
PABPC4Q13310 CDK2-201ENST00000266970 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.011e-9■■■■□ 21.3
PABPC4Q13310 ITM2A-205ENST00000469541 879 ntTSL 29.62□□□□□ -0.872e-20■■■■□ 21.3
PABPC4Q13310 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.33e-9■■■■□ 21.3
PABPC4Q13310 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.183e-9■■■■□ 21.3
PABPC4Q13310 TPT1-206ENST00000484604 794 ntTSL 29.25□□□□□ -0.933e-13■■■■□ 21.3
PABPC4Q13310 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.098e-11■■■■□ 21.3
PABPC4Q13310 RPS14-205ENST00000519690 3119 ntTSL 216.87■□□□□ 0.298e-11■■■■□ 21.3
PABPC4Q13310 RPS14-202ENST00000401695 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.268e-11■■■■□ 21.3
PABPC4Q13310 CCNG1-207ENST00000510097 564 ntTSL 417.37■□□□□ 0.373e-9■■■■□ 21.2
PABPC4Q13310 CCNG1-212ENST00000512532 540 ntTSL 25.15□□□□□ -1.593e-9■■■■□ 21.2
PABPC4Q13310 APEH-213ENST00000480772 703 ntTSL 215.83■□□□□ 0.129e-9■■■■□ 21.2
PABPC4Q13310 APEH-201ENST00000296456 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.199e-9■■■■□ 21.2
PABPC4Q13310 RPL21-210ENST00000493317 438 ntTSL 23.66□□□□□ -1.826e-22■■■■□ 21.2
PABPC4Q13310 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.123e-18■■■■□ 21.2
PABPC4Q13310 TIMM17B-206ENST00000472645 804 ntTSL 319.72■□□□□ 0.752e-8■■■■□ 21.2
PABPC4Q13310 RPL36A-207ENST00000489407 373 ntTSL 25.63□□□□□ -1.515e-58■■■■□ 21.2
PABPC4Q13310 COPS3-205ENST00000463097 288 ntTSL 27.88□□□□□ -1.151e-8■■■■□ 21.2
PABPC4Q13310 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.914e-15■■■■□ 21.2
PABPC4Q13310 SCNM1-207ENST00000602841 749 ntTSL 312.23□□□□□ -0.456e-7■■■■□ 21.2
PABPC4Q13310 SCNM1-206ENST00000497147 862 ntTSL 211.86□□□□□ -0.516e-7■■■■□ 21.2
PABPC4Q13310 SCNM1-203ENST00000459799 619 ntTSL 211.33□□□□□ -0.66e-7■■■■□ 21.2
PABPC4Q13310 SCNM1-202ENST00000368905 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.76e-7■■■■□ 21.2
PABPC4Q13310 SCNM1-201ENST00000368902 869 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.736e-7■■■■□ 21.2
PABPC4Q13310 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.572e-6■■■■□ 21.2
PABPC4Q13310 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.122e-6■■■■□ 21.2
PABPC4Q13310 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.072e-6■■■■□ 21.2
PABPC4Q13310 CNOT3-209ENST00000617930 2047 ntTSL 219.46■□□□□ 0.712e-10■■■■□ 21.2
PABPC4Q13310 CNOT3-206ENST00000471126 541 ntTSL 318.37■□□□□ 0.532e-10■■■■□ 21.2
PABPC4Q13310 CNOT3-208ENST00000613073 2778 ntTSL 218.13■□□□□ 0.492e-10■■■■□ 21.2
PABPC4Q13310 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.332e-10■■■■□ 21.2
PABPC4Q13310 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.182e-10■■■■□ 21.2
PABPC4Q13310 CNOT3-210ENST00000618939 4516 ntTSL 515.31■□□□□ 0.042e-10■■■■□ 21.2
PABPC4Q13310 CNOT3-202ENST00000358389 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.462e-10■■■■□ 21.2
PABPC4Q13310 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.642e-11■■■■□ 21.2
PABPC4Q13310 NDUFA2-204ENST00000512088 627 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.212e-11■■■■□ 21.2
PABPC4Q13310 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.164e-9■■■■□ 21.2
PABPC4Q13310 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.883e-8■■■■□ 21.2
PABPC4Q13310 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.713e-8■■■■□ 21.2
PABPC4Q13310 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.292e-7■■■■□ 21.2
PABPC4Q13310 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.912e-7■■■■□ 21.2
PABPC4Q13310 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.12e-7■■■■□ 21.2
PABPC4Q13310 LRRC75A-AS1-214ENST00000487066 763 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.173e-38■■■■□ 21.2
PABPC4Q13310 RPF1-201ENST00000370654 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.162e-10■■■■□ 21.2
PABPC4Q13310 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.397e-6■■■■□ 21.2
PABPC4Q13310 BHLHE40-201ENST00000256495 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.152e-8■■■■□ 21.2
PABPC4Q13310 TOR1AIP1-212ENST00000606911 8704 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.337e-6■■■■□ 21.2
PABPC4Q13310 TOR1AIP1-202ENST00000435319 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.267e-6■■■■□ 21.2
PABPC4Q13310 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.95e-10■■■■□ 21.2
PABPC4Q13310 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.95e-10■■■■□ 21.2
PABPC4Q13310 C19orf60-205ENST00000597371 1081 ntTSL 326.33■■□□□ 1.815e-10■■■■□ 21.2
PABPC4Q13310 C19orf60-206ENST00000598375 1792 ntTSL 525.03■■□□□ 1.65e-10■■■■□ 21.2
PABPC4Q13310 C19orf60-207ENST00000600997 2275 ntTSL 222.99■■□□□ 1.275e-10■■■■□ 21.2
PABPC4Q13310 C19orf60-208ENST00000601736 491 ntTSL 220.65■□□□□ 0.95e-10■■■■□ 21.2
PABPC4Q13310 IFITM3-203ENST00000531688 500 ntTSL 312.92□□□□□ -0.341e-19■■■■□ 21.2
PABPC4Q13310 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.74e-20■■■■□ 21.1
PABPC4Q13310 SRSF9-206ENST00000603963 1043 ntTSL 526.43■■□□□ 1.824e-20■■■■□ 21.1
PABPC4Q13310 SRSF9-204ENST00000548792 1446 ntTSL 211.17□□□□□ -0.624e-20■■■■□ 21.1
PABPC4Q13310 SRSF9-203ENST00000548326 1704 nt9.5□□□□□ -0.894e-20■■■■□ 21.1
PABPC4Q13310 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.272e-6■■■■□ 21.1
PABPC4Q13310 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.162e-6■■■■□ 21.1
PABPC4Q13310 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.732e-6■■■■□ 21.1
PABPC4Q13310 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.662e-6■■■■□ 21.1
PABPC4Q13310 FSCN3-204ENST00000478328 705 ntTSL 1 (best)16.23■□□□□ 0.192e-47■■■■□ 21.1
PABPC4Q13310 LRRC75A-AS1-203ENST00000472367 794 ntTSL 321.52■■□□□ 1.042e-38■■■■□ 21.1
PABPC4Q13310 LRRC75A-AS1-212ENST00000483588 688 ntTSL 320.63■□□□□ 0.892e-38■■■■□ 21.1
PABPC4Q13310 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.322e-38■■■■□ 21.1
PABPC4Q13310 LRRC75A-AS1-207ENST00000478103 712 ntTSL 312.65□□□□□ -0.382e-38■■■■□ 21.1
PABPC4Q13310 LRRC75A-AS1-211ENST00000483140 936 ntTSL 26.45□□□□□ -1.382e-38■■■■□ 21.1
PABPC4Q13310 STARD10-205ENST00000535267 579 ntTSL 231.2■■■□□ 2.595e-9■■■■□ 21.1
PABPC4Q13310 STARD10-203ENST00000535054 460 ntTSL 330.09■■■□□ 2.415e-9■■■■□ 21.1
PABPC4Q13310 STARD10-206ENST00000536290 438 ntTSL 521.07■□□□□ 0.965e-9■■■■□ 21.1
PABPC4Q13310 STARD10-214ENST00000539138 511 ntTSL 320.46■□□□□ 0.875e-9■■■■□ 21.1
PABPC4Q13310 STARD10-211ENST00000538009 985 ntTSL 1 (best)19.78■□□□□ 0.765e-9■■■■□ 21.1
PABPC4Q13310 STARD10-221ENST00000546314 620 ntTSL 319.22■□□□□ 0.675e-9■■■■□ 21.1
PABPC4Q13310 STARD10-207ENST00000536377 798 ntTSL 516.64■□□□□ 0.255e-9■■■■□ 21.1
PABPC4Q13310 MAP3K10-207ENST00000597986 2104 ntTSL 525.79■■□□□ 1.721e-6■■■■□ 21.1
PABPC4Q13310 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.321e-6■■■■□ 21.1
PABPC4Q13310 RPS29-208ENST00000557519 333 ntTSL 311.73□□□□□ -0.539e-46■■■■□ 21.1
PABPC4Q13310 ALAS2-208ENST00000498636 959 ntTSL 315.05■□□□□ -04e-9■■■■□ 21.1
PABPC4Q13310 SNRPD1-204ENST00000582475 723 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.142e-21■■■■□ 21.1
PABPC4Q13310 SNRPD1-201ENST00000300413 4909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.882e-21■■■■□ 21.1
PABPC4Q13310 DCXR-211ENST00000579821 452 ntTSL 315.3■□□□□ 0.045e-13■■■■□ 21.1
PABPC4Q13310 TRUB2-201ENST00000372890 5719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.292e-13■■■■□ 21.1
PABPC4Q13310 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.349e-7■■■■□ 21.1
PABPC4Q13310 MANF-202ENST00000470900 1509 ntTSL 229.68■■■□□ 2.349e-7■■■■□ 21.1
PABPC4Q13310 MANF-201ENST00000446668 846 ntTSL 325.26■■□□□ 1.639e-7■■■■□ 21.1
PABPC4Q13310 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.572e-7■■■■□ 21.1
PABPC4Q13310 RAB13-203ENST00000484297 643 ntTSL 57.84□□□□□ -1.155e-7■■■■□ 21.1
PABPC4Q13310 METTL7A-204ENST00000550097 1846 ntTSL 516.77■□□□□ 0.282e-6■■■■□ 21.1
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