Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RBBP4Q09028 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RBBP4Q09028 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RBBP4Q09028 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RBBP4Q09028 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RBBP4Q09028 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RBBP4Q09028 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RBBP4Q09028 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RBBP4Q09028 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RBBP4Q09028 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RBBP4Q09028 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RBBP4Q09028 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RBBP4Q09028 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RBBP4Q09028 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RBBP4Q09028 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RBBP4Q09028 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RBBP4Q09028 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RBBP4Q09028 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RBBP4Q09028 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
RBBP4Q09028 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RBBP4Q09028 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RBBP4Q09028 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RBBP4Q09028 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RBBP4Q09028 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RBBP4Q09028 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RBBP4Q09028 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RBBP4Q09028 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RBBP4Q09028 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RBBP4Q09028 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RBBP4Q09028 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RBBP4Q09028 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RBBP4Q09028 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RBBP4Q09028 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RBBP4Q09028 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RBBP4Q09028 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RBBP4Q09028 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RBBP4Q09028 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RBBP4Q09028 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RBBP4Q09028 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RBBP4Q09028 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RBBP4Q09028 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RBBP4Q09028 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RBBP4Q09028 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RBBP4Q09028 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RBBP4Q09028 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RBBP4Q09028 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RBBP4Q09028 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RBBP4Q09028 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RBBP4Q09028 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RBBP4Q09028 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RBBP4Q09028 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
RBBP4Q09028 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RBBP4Q09028 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RBBP4Q09028 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RBBP4Q09028 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RBBP4Q09028 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RBBP4Q09028 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RBBP4Q09028 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RBBP4Q09028 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RBBP4Q09028 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RBBP4Q09028 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RBBP4Q09028 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RBBP4Q09028 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RBBP4Q09028 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
RBBP4Q09028 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RBBP4Q09028 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RBBP4Q09028 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RBBP4Q09028 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RBBP4Q09028 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RBBP4Q09028 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RBBP4Q09028 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RBBP4Q09028 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RBBP4Q09028 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RBBP4Q09028 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
RBBP4Q09028 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RBBP4Q09028 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RBBP4Q09028 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RBBP4Q09028 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RBBP4Q09028 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RBBP4Q09028 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RBBP4Q09028 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RBBP4Q09028 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RBBP4Q09028 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RBBP4Q09028 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RBBP4Q09028 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RBBP4Q09028 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RBBP4Q09028 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RBBP4Q09028 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RBBP4Q09028 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RBBP4Q09028 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
RBBP4Q09028 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RBBP4Q09028 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RBBP4Q09028 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RBBP4Q09028 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RBBP4Q09028 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RBBP4Q09028 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RBBP4Q09028 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RBBP4Q09028 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RBBP4Q09028 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RBBP4Q09028 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms