Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPN11Q06124 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPN11Q06124 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPN11Q06124 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPN11Q06124 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPN11Q06124 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPN11Q06124 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPN11Q06124 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPN11Q06124 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPN11Q06124 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPN11Q06124 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPN11Q06124 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPN11Q06124 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPN11Q06124 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPN11Q06124 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPN11Q06124 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPN11Q06124 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPN11Q06124 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPN11Q06124 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPN11Q06124 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPN11Q06124 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPN11Q06124 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPN11Q06124 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPN11Q06124 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPN11Q06124 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPN11Q06124 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPN11Q06124 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPN11Q06124 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPN11Q06124 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPN11Q06124 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPN11Q06124 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPN11Q06124 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPN11Q06124 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPN11Q06124 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPN11Q06124 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPN11Q06124 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPN11Q06124 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPN11Q06124 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPN11Q06124 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPN11Q06124 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPN11Q06124 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPN11Q06124 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPN11Q06124 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPN11Q06124 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPN11Q06124 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPN11Q06124 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPN11Q06124 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPN11Q06124 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPN11Q06124 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPN11Q06124 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPN11Q06124 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPN11Q06124 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPN11Q06124 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPN11Q06124 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPN11Q06124 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPN11Q06124 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPN11Q06124 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPN11Q06124 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPN11Q06124 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPN11Q06124 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPN11Q06124 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPN11Q06124 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPN11Q06124 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPN11Q06124 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPN11Q06124 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPN11Q06124 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPN11Q06124 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPN11Q06124 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPN11Q06124 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPN11Q06124 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPN11Q06124 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPN11Q06124 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPN11Q06124 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPN11Q06124 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPN11Q06124 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPN11Q06124 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPN11Q06124 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPN11Q06124 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPN11Q06124 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPN11Q06124 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPN11Q06124 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPN11Q06124 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPN11Q06124 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPN11Q06124 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPN11Q06124 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPN11Q06124 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPN11Q06124 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPN11Q06124 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPN11Q06124 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPN11Q06124 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPN11Q06124 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPN11Q06124 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPN11Q06124 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPN11Q06124 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPN11Q06124 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPN11Q06124 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPN11Q06124 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPN11Q06124 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPN11Q06124 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPN11Q06124 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms