Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CALD1Q05682 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CALD1Q05682 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CALD1Q05682 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CALD1Q05682 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CALD1Q05682 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CALD1Q05682 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CALD1Q05682 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CALD1Q05682 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CALD1Q05682 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CALD1Q05682 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CALD1Q05682 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CALD1Q05682 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CALD1Q05682 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CALD1Q05682 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CALD1Q05682 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CALD1Q05682 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CALD1Q05682 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CALD1Q05682 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CALD1Q05682 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CALD1Q05682 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CALD1Q05682 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CALD1Q05682 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CALD1Q05682 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CALD1Q05682 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CALD1Q05682 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CALD1Q05682 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CALD1Q05682 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CALD1Q05682 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CALD1Q05682 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CALD1Q05682 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CALD1Q05682 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CALD1Q05682 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CALD1Q05682 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CALD1Q05682 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CALD1Q05682 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CALD1Q05682 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CALD1Q05682 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CALD1Q05682 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CALD1Q05682 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CALD1Q05682 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CALD1Q05682 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CALD1Q05682 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CALD1Q05682 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CALD1Q05682 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CALD1Q05682 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CALD1Q05682 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CALD1Q05682 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CALD1Q05682 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CALD1Q05682 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CALD1Q05682 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CALD1Q05682 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CALD1Q05682 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CALD1Q05682 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CALD1Q05682 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CALD1Q05682 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CALD1Q05682 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CALD1Q05682 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CALD1Q05682 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CALD1Q05682 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CALD1Q05682 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CALD1Q05682 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CALD1Q05682 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CALD1Q05682 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CALD1Q05682 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CALD1Q05682 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CALD1Q05682 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CALD1Q05682 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CALD1Q05682 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CALD1Q05682 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CALD1Q05682 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
CALD1Q05682 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CALD1Q05682 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CALD1Q05682 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CALD1Q05682 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CALD1Q05682 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CALD1Q05682 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CALD1Q05682 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CALD1Q05682 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CALD1Q05682 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CALD1Q05682 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CALD1Q05682 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CALD1Q05682 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CALD1Q05682 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CALD1Q05682 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CALD1Q05682 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CALD1Q05682 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CALD1Q05682 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CALD1Q05682 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CALD1Q05682 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CALD1Q05682 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CALD1Q05682 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CALD1Q05682 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CALD1Q05682 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CALD1Q05682 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CALD1Q05682 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CALD1Q05682 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CALD1Q05682 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CALD1Q05682 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CALD1Q05682 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms