Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPTBN1Q01082 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPTBN1Q01082 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPTBN1Q01082 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPTBN1Q01082 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPTBN1Q01082 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPTBN1Q01082 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPTBN1Q01082 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPTBN1Q01082 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPTBN1Q01082 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPTBN1Q01082 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPTBN1Q01082 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPTBN1Q01082 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPTBN1Q01082 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SPTBN1Q01082 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPTBN1Q01082 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPTBN1Q01082 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPTBN1Q01082 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPTBN1Q01082 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPTBN1Q01082 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPTBN1Q01082 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPTBN1Q01082 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPTBN1Q01082 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPTBN1Q01082 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPTBN1Q01082 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPTBN1Q01082 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPTBN1Q01082 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPTBN1Q01082 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPTBN1Q01082 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPTBN1Q01082 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SPTBN1Q01082 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SPTBN1Q01082 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPTBN1Q01082 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPTBN1Q01082 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPTBN1Q01082 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPTBN1Q01082 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPTBN1Q01082 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPTBN1Q01082 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPTBN1Q01082 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPTBN1Q01082 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPTBN1Q01082 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPTBN1Q01082 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPTBN1Q01082 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPTBN1Q01082 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPTBN1Q01082 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPTBN1Q01082 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPTBN1Q01082 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPTBN1Q01082 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPTBN1Q01082 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SPTBN1Q01082 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPTBN1Q01082 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPTBN1Q01082 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SPTBN1Q01082 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPTBN1Q01082 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPTBN1Q01082 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPTBN1Q01082 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPTBN1Q01082 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPTBN1Q01082 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPTBN1Q01082 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPTBN1Q01082 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPTBN1Q01082 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPTBN1Q01082 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPTBN1Q01082 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPTBN1Q01082 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SPTBN1Q01082 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPTBN1Q01082 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPTBN1Q01082 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPTBN1Q01082 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPTBN1Q01082 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPTBN1Q01082 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPTBN1Q01082 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPTBN1Q01082 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPTBN1Q01082 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPTBN1Q01082 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPTBN1Q01082 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPTBN1Q01082 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPTBN1Q01082 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPTBN1Q01082 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPTBN1Q01082 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPTBN1Q01082 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPTBN1Q01082 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPTBN1Q01082 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPTBN1Q01082 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SPTBN1Q01082 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SPTBN1Q01082 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SPTBN1Q01082 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPTBN1Q01082 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPTBN1Q01082 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPTBN1Q01082 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPTBN1Q01082 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPTBN1Q01082 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPTBN1Q01082 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPTBN1Q01082 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPTBN1Q01082 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPTBN1Q01082 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPTBN1Q01082 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPTBN1Q01082 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPTBN1Q01082 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPTBN1Q01082 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SPTBN1Q01082 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms