Protein–RNA interactions for Protein: P98155

VLDLR, Very low-density lipoprotein receptor, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VLDLRP98155 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VLDLRP98155 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VLDLRP98155 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VLDLRP98155 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VLDLRP98155 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
VLDLRP98155 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VLDLRP98155 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VLDLRP98155 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
VLDLRP98155 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VLDLRP98155 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VLDLRP98155 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VLDLRP98155 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VLDLRP98155 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VLDLRP98155 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VLDLRP98155 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VLDLRP98155 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VLDLRP98155 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VLDLRP98155 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VLDLRP98155 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VLDLRP98155 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VLDLRP98155 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VLDLRP98155 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
VLDLRP98155 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VLDLRP98155 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VLDLRP98155 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VLDLRP98155 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VLDLRP98155 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VLDLRP98155 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VLDLRP98155 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VLDLRP98155 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VLDLRP98155 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VLDLRP98155 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VLDLRP98155 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VLDLRP98155 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VLDLRP98155 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VLDLRP98155 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VLDLRP98155 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VLDLRP98155 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VLDLRP98155 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VLDLRP98155 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VLDLRP98155 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VLDLRP98155 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VLDLRP98155 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VLDLRP98155 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VLDLRP98155 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VLDLRP98155 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VLDLRP98155 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VLDLRP98155 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VLDLRP98155 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VLDLRP98155 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VLDLRP98155 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VLDLRP98155 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VLDLRP98155 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VLDLRP98155 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VLDLRP98155 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VLDLRP98155 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VLDLRP98155 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VLDLRP98155 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VLDLRP98155 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VLDLRP98155 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VLDLRP98155 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VLDLRP98155 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VLDLRP98155 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VLDLRP98155 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VLDLRP98155 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VLDLRP98155 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VLDLRP98155 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VLDLRP98155 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VLDLRP98155 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VLDLRP98155 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VLDLRP98155 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VLDLRP98155 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VLDLRP98155 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
VLDLRP98155 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VLDLRP98155 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VLDLRP98155 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VLDLRP98155 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VLDLRP98155 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VLDLRP98155 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VLDLRP98155 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VLDLRP98155 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VLDLRP98155 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VLDLRP98155 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VLDLRP98155 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VLDLRP98155 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VLDLRP98155 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VLDLRP98155 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VLDLRP98155 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VLDLRP98155 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VLDLRP98155 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VLDLRP98155 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VLDLRP98155 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VLDLRP98155 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
VLDLRP98155 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VLDLRP98155 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VLDLRP98155 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VLDLRP98155 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
VLDLRP98155 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VLDLRP98155 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VLDLRP98155 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms