Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HERVK_113P63132 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HERVK_113P63132 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HERVK_113P63132 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HERVK_113P63132 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HERVK_113P63132 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HERVK_113P63132 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HERVK_113P63132 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HERVK_113P63132 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HERVK_113P63132 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HERVK_113P63132 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HERVK_113P63132 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HERVK_113P63132 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HERVK_113P63132 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HERVK_113P63132 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HERVK_113P63132 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HERVK_113P63132 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HERVK_113P63132 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HERVK_113P63132 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HERVK_113P63132 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HERVK_113P63132 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HERVK_113P63132 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HERVK_113P63132 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HERVK_113P63132 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HERVK_113P63132 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HERVK_113P63132 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HERVK_113P63132 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HERVK_113P63132 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HERVK_113P63132 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HERVK_113P63132 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HERVK_113P63132 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HERVK_113P63132 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HERVK_113P63132 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HERVK_113P63132 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HERVK_113P63132 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HERVK_113P63132 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HERVK_113P63132 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HERVK_113P63132 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HERVK_113P63132 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HERVK_113P63132 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HERVK_113P63132 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HERVK_113P63132 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
HERVK_113P63132 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HERVK_113P63132 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HERVK_113P63132 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HERVK_113P63132 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HERVK_113P63132 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HERVK_113P63132 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HERVK_113P63132 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HERVK_113P63132 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HERVK_113P63132 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HERVK_113P63132 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HERVK_113P63132 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HERVK_113P63132 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HERVK_113P63132 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HERVK_113P63132 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HERVK_113P63132 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HERVK_113P63132 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HERVK_113P63132 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HERVK_113P63132 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HERVK_113P63132 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HERVK_113P63132 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
HERVK_113P63132 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
HERVK_113P63132 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
HERVK_113P63132 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HERVK_113P63132 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HERVK_113P63132 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HERVK_113P63132 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HERVK_113P63132 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HERVK_113P63132 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HERVK_113P63132 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HERVK_113P63132 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HERVK_113P63132 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HERVK_113P63132 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HERVK_113P63132 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
HERVK_113P63132 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
HERVK_113P63132 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HERVK_113P63132 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HERVK_113P63132 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HERVK_113P63132 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HERVK_113P63132 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HERVK_113P63132 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HERVK_113P63132 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HERVK_113P63132 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HERVK_113P63132 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
HERVK_113P63132 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HERVK_113P63132 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HERVK_113P63132 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HERVK_113P63132 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HERVK_113P63132 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HERVK_113P63132 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HERVK_113P63132 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HERVK_113P63132 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HERVK_113P63132 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HERVK_113P63132 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HERVK_113P63132 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HERVK_113P63132 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HERVK_113P63132 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HERVK_113P63132 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HERVK_113P63132 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms