Protein–RNA interactions for Protein: P58499

FAM3B, Protein FAM3B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3BP58499 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM3BP58499 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM3BP58499 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM3BP58499 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM3BP58499 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM3BP58499 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM3BP58499 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM3BP58499 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM3BP58499 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM3BP58499 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM3BP58499 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM3BP58499 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM3BP58499 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM3BP58499 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM3BP58499 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM3BP58499 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM3BP58499 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM3BP58499 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM3BP58499 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM3BP58499 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM3BP58499 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM3BP58499 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM3BP58499 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM3BP58499 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM3BP58499 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM3BP58499 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM3BP58499 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM3BP58499 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM3BP58499 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM3BP58499 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM3BP58499 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM3BP58499 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM3BP58499 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM3BP58499 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM3BP58499 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM3BP58499 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM3BP58499 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM3BP58499 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM3BP58499 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM3BP58499 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM3BP58499 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM3BP58499 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM3BP58499 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM3BP58499 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM3BP58499 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM3BP58499 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM3BP58499 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM3BP58499 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM3BP58499 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM3BP58499 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM3BP58499 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM3BP58499 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM3BP58499 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM3BP58499 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM3BP58499 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM3BP58499 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM3BP58499 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM3BP58499 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM3BP58499 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM3BP58499 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM3BP58499 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM3BP58499 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM3BP58499 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM3BP58499 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM3BP58499 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM3BP58499 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM3BP58499 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM3BP58499 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM3BP58499 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM3BP58499 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM3BP58499 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM3BP58499 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM3BP58499 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM3BP58499 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM3BP58499 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM3BP58499 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM3BP58499 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM3BP58499 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM3BP58499 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM3BP58499 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM3BP58499 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM3BP58499 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM3BP58499 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM3BP58499 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM3BP58499 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM3BP58499 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM3BP58499 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM3BP58499 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM3BP58499 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM3BP58499 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM3BP58499 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM3BP58499 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM3BP58499 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM3BP58499 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM3BP58499 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM3BP58499 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM3BP58499 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM3BP58499 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM3BP58499 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM3BP58499 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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