Protein–RNA interactions for Protein: P49639

HOXA1, Homeobox protein Hox-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA1P49639 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA1P49639 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA1P49639 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA1P49639 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA1P49639 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA1P49639 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA1P49639 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA1P49639 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA1P49639 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA1P49639 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA1P49639 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA1P49639 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA1P49639 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA1P49639 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA1P49639 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA1P49639 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA1P49639 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA1P49639 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA1P49639 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA1P49639 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA1P49639 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA1P49639 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA1P49639 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA1P49639 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA1P49639 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA1P49639 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA1P49639 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA1P49639 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA1P49639 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA1P49639 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA1P49639 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA1P49639 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA1P49639 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA1P49639 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA1P49639 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA1P49639 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA1P49639 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA1P49639 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA1P49639 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA1P49639 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA1P49639 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA1P49639 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA1P49639 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA1P49639 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA1P49639 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA1P49639 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA1P49639 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA1P49639 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA1P49639 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA1P49639 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA1P49639 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA1P49639 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA1P49639 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA1P49639 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA1P49639 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXA1P49639 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXA1P49639 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXA1P49639 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXA1P49639 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXA1P49639 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXA1P49639 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXA1P49639 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXA1P49639 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXA1P49639 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXA1P49639 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXA1P49639 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXA1P49639 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXA1P49639 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXA1P49639 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXA1P49639 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXA1P49639 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXA1P49639 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXA1P49639 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXA1P49639 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXA1P49639 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXA1P49639 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXA1P49639 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXA1P49639 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXA1P49639 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXA1P49639 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXA1P49639 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXA1P49639 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXA1P49639 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXA1P49639 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXA1P49639 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXA1P49639 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXA1P49639 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXA1P49639 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXA1P49639 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXA1P49639 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXA1P49639 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXA1P49639 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXA1P49639 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXA1P49639 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXA1P49639 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXA1P49639 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXA1P49639 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXA1P49639 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXA1P49639 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXA1P49639 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms