Protein–RNA interactions for Protein: P28328

PEX2, Peroxisome biogenesis factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX2P28328 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PEX2P28328 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PEX2P28328 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PEX2P28328 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PEX2P28328 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PEX2P28328 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PEX2P28328 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PEX2P28328 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PEX2P28328 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PEX2P28328 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PEX2P28328 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PEX2P28328 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PEX2P28328 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PEX2P28328 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PEX2P28328 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PEX2P28328 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PEX2P28328 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PEX2P28328 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PEX2P28328 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PEX2P28328 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
PEX2P28328 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PEX2P28328 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PEX2P28328 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PEX2P28328 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PEX2P28328 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PEX2P28328 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PEX2P28328 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PEX2P28328 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PEX2P28328 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PEX2P28328 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PEX2P28328 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PEX2P28328 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PEX2P28328 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PEX2P28328 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PEX2P28328 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PEX2P28328 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PEX2P28328 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PEX2P28328 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PEX2P28328 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PEX2P28328 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PEX2P28328 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PEX2P28328 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PEX2P28328 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PEX2P28328 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PEX2P28328 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PEX2P28328 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PEX2P28328 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PEX2P28328 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PEX2P28328 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PEX2P28328 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PEX2P28328 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PEX2P28328 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PEX2P28328 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PEX2P28328 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PEX2P28328 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PEX2P28328 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PEX2P28328 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PEX2P28328 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PEX2P28328 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PEX2P28328 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PEX2P28328 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PEX2P28328 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PEX2P28328 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PEX2P28328 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PEX2P28328 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PEX2P28328 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PEX2P28328 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PEX2P28328 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PEX2P28328 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PEX2P28328 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PEX2P28328 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PEX2P28328 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PEX2P28328 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PEX2P28328 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PEX2P28328 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PEX2P28328 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PEX2P28328 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PEX2P28328 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PEX2P28328 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PEX2P28328 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PEX2P28328 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PEX2P28328 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PEX2P28328 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PEX2P28328 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PEX2P28328 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PEX2P28328 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PEX2P28328 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PEX2P28328 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PEX2P28328 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PEX2P28328 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PEX2P28328 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PEX2P28328 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PEX2P28328 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PEX2P28328 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PEX2P28328 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PEX2P28328 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PEX2P28328 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PEX2P28328 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PEX2P28328 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PEX2P28328 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms