Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HLA-DMAP28067 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HLA-DMAP28067 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HLA-DMAP28067 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HLA-DMAP28067 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HLA-DMAP28067 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HLA-DMAP28067 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HLA-DMAP28067 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HLA-DMAP28067 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HLA-DMAP28067 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HLA-DMAP28067 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HLA-DMAP28067 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HLA-DMAP28067 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HLA-DMAP28067 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HLA-DMAP28067 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HLA-DMAP28067 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HLA-DMAP28067 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HLA-DMAP28067 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HLA-DMAP28067 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HLA-DMAP28067 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HLA-DMAP28067 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HLA-DMAP28067 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HLA-DMAP28067 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HLA-DMAP28067 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HLA-DMAP28067 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HLA-DMAP28067 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HLA-DMAP28067 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HLA-DMAP28067 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HLA-DMAP28067 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HLA-DMAP28067 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HLA-DMAP28067 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HLA-DMAP28067 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HLA-DMAP28067 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HLA-DMAP28067 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HLA-DMAP28067 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HLA-DMAP28067 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HLA-DMAP28067 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HLA-DMAP28067 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HLA-DMAP28067 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HLA-DMAP28067 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HLA-DMAP28067 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HLA-DMAP28067 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HLA-DMAP28067 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HLA-DMAP28067 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HLA-DMAP28067 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HLA-DMAP28067 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HLA-DMAP28067 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HLA-DMAP28067 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HLA-DMAP28067 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HLA-DMAP28067 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HLA-DMAP28067 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HLA-DMAP28067 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HLA-DMAP28067 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HLA-DMAP28067 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
HLA-DMAP28067 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HLA-DMAP28067 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HLA-DMAP28067 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HLA-DMAP28067 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HLA-DMAP28067 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HLA-DMAP28067 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HLA-DMAP28067 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HLA-DMAP28067 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HLA-DMAP28067 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HLA-DMAP28067 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HLA-DMAP28067 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HLA-DMAP28067 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HLA-DMAP28067 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HLA-DMAP28067 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HLA-DMAP28067 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
HLA-DMAP28067 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
HLA-DMAP28067 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
HLA-DMAP28067 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
HLA-DMAP28067 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HLA-DMAP28067 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HLA-DMAP28067 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HLA-DMAP28067 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HLA-DMAP28067 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HLA-DMAP28067 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HLA-DMAP28067 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HLA-DMAP28067 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HLA-DMAP28067 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HLA-DMAP28067 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HLA-DMAP28067 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HLA-DMAP28067 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HLA-DMAP28067 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HLA-DMAP28067 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
HLA-DMAP28067 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HLA-DMAP28067 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HLA-DMAP28067 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HLA-DMAP28067 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HLA-DMAP28067 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HLA-DMAP28067 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HLA-DMAP28067 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HLA-DMAP28067 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
HLA-DMAP28067 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HLA-DMAP28067 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HLA-DMAP28067 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HLA-DMAP28067 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HLA-DMAP28067 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HLA-DMAP28067 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms