Protein–RNA interactions for Protein: P0C866

LINC00869, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00869, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00869P0C866 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00869P0C866 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00869P0C866 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00869P0C866 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00869P0C866 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00869P0C866 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00869P0C866 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00869P0C866 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00869P0C866 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00869P0C866 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00869P0C866 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00869P0C866 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00869P0C866 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00869P0C866 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00869P0C866 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00869P0C866 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00869P0C866 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00869P0C866 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00869P0C866 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00869P0C866 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00869P0C866 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00869P0C866 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00869P0C866 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00869P0C866 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00869P0C866 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00869P0C866 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00869P0C866 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00869P0C866 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00869P0C866 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00869P0C866 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00869P0C866 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00869P0C866 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00869P0C866 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00869P0C866 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00869P0C866 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00869P0C866 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00869P0C866 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00869P0C866 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00869P0C866 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00869P0C866 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00869P0C866 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00869P0C866 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00869P0C866 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00869P0C866 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00869P0C866 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00869P0C866 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00869P0C866 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00869P0C866 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00869P0C866 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00869P0C866 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00869P0C866 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00869P0C866 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00869P0C866 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00869P0C866 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00869P0C866 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00869P0C866 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00869P0C866 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LINC00869P0C866 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LINC00869P0C866 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LINC00869P0C866 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LINC00869P0C866 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LINC00869P0C866 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LINC00869P0C866 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
LINC00869P0C866 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00869P0C866 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00869P0C866 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00869P0C866 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00869P0C866 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00869P0C866 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00869P0C866 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00869P0C866 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00869P0C866 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00869P0C866 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00869P0C866 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00869P0C866 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00869P0C866 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00869P0C866 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00869P0C866 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00869P0C866 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00869P0C866 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00869P0C866 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00869P0C866 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00869P0C866 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00869P0C866 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00869P0C866 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00869P0C866 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00869P0C866 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00869P0C866 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00869P0C866 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00869P0C866 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00869P0C866 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00869P0C866 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00869P0C866 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00869P0C866 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00869P0C866 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00869P0C866 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00869P0C866 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00869P0C866 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00869P0C866 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00869P0C866 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms