Protein–RNA interactions for Protein: C9JDP6

CLDN25, Putative claudin-25, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN25C9JDP6 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLDN25C9JDP6 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLDN25C9JDP6 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLDN25C9JDP6 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLDN25C9JDP6 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLDN25C9JDP6 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLDN25C9JDP6 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLDN25C9JDP6 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLDN25C9JDP6 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLDN25C9JDP6 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLDN25C9JDP6 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLDN25C9JDP6 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLDN25C9JDP6 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLDN25C9JDP6 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLDN25C9JDP6 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLDN25C9JDP6 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLDN25C9JDP6 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLDN25C9JDP6 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLDN25C9JDP6 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLDN25C9JDP6 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLDN25C9JDP6 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLDN25C9JDP6 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLDN25C9JDP6 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLDN25C9JDP6 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLDN25C9JDP6 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLDN25C9JDP6 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLDN25C9JDP6 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLDN25C9JDP6 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CLDN25C9JDP6 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLDN25C9JDP6 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLDN25C9JDP6 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLDN25C9JDP6 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLDN25C9JDP6 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLDN25C9JDP6 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLDN25C9JDP6 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLDN25C9JDP6 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLDN25C9JDP6 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLDN25C9JDP6 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLDN25C9JDP6 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLDN25C9JDP6 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLDN25C9JDP6 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLDN25C9JDP6 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLDN25C9JDP6 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLDN25C9JDP6 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLDN25C9JDP6 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLDN25C9JDP6 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLDN25C9JDP6 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLDN25C9JDP6 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLDN25C9JDP6 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLDN25C9JDP6 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLDN25C9JDP6 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLDN25C9JDP6 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLDN25C9JDP6 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLDN25C9JDP6 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLDN25C9JDP6 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLDN25C9JDP6 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLDN25C9JDP6 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLDN25C9JDP6 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLDN25C9JDP6 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLDN25C9JDP6 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLDN25C9JDP6 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLDN25C9JDP6 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLDN25C9JDP6 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLDN25C9JDP6 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLDN25C9JDP6 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLDN25C9JDP6 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLDN25C9JDP6 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLDN25C9JDP6 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLDN25C9JDP6 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLDN25C9JDP6 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLDN25C9JDP6 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLDN25C9JDP6 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLDN25C9JDP6 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLDN25C9JDP6 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLDN25C9JDP6 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLDN25C9JDP6 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLDN25C9JDP6 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLDN25C9JDP6 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLDN25C9JDP6 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CLDN25C9JDP6 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLDN25C9JDP6 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLDN25C9JDP6 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLDN25C9JDP6 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLDN25C9JDP6 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLDN25C9JDP6 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLDN25C9JDP6 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLDN25C9JDP6 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLDN25C9JDP6 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLDN25C9JDP6 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLDN25C9JDP6 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLDN25C9JDP6 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLDN25C9JDP6 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLDN25C9JDP6 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLDN25C9JDP6 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLDN25C9JDP6 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLDN25C9JDP6 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLDN25C9JDP6 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLDN25C9JDP6 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLDN25C9JDP6 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLDN25C9JDP6 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms