Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y376

CAB39, Calcium-binding protein 39, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAB39Q9Y376 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CAB39Q9Y376 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CAB39Q9Y376 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CAB39Q9Y376 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CAB39Q9Y376 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CAB39Q9Y376 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CAB39Q9Y376 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CAB39Q9Y376 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CAB39Q9Y376 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CAB39Q9Y376 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CAB39Q9Y376 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CAB39Q9Y376 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CAB39Q9Y376 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CAB39Q9Y376 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CAB39Q9Y376 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CAB39Q9Y376 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CAB39Q9Y376 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CAB39Q9Y376 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CAB39Q9Y376 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CAB39Q9Y376 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CAB39Q9Y376 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CAB39Q9Y376 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CAB39Q9Y376 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CAB39Q9Y376 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CAB39Q9Y376 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CAB39Q9Y376 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CAB39Q9Y376 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CAB39Q9Y376 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CAB39Q9Y376 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CAB39Q9Y376 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CAB39Q9Y376 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CAB39Q9Y376 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CAB39Q9Y376 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CAB39Q9Y376 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CAB39Q9Y376 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CAB39Q9Y376 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CAB39Q9Y376 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CAB39Q9Y376 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CAB39Q9Y376 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CAB39Q9Y376 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CAB39Q9Y376 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CAB39Q9Y376 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CAB39Q9Y376 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CAB39Q9Y376 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CAB39Q9Y376 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CAB39Q9Y376 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CAB39Q9Y376 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CAB39Q9Y376 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CAB39Q9Y376 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CAB39Q9Y376 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CAB39Q9Y376 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CAB39Q9Y376 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CAB39Q9Y376 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CAB39Q9Y376 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CAB39Q9Y376 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CAB39Q9Y376 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CAB39Q9Y376 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CAB39Q9Y376 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CAB39Q9Y376 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CAB39Q9Y376 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CAB39Q9Y376 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CAB39Q9Y376 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CAB39Q9Y376 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CAB39Q9Y376 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CAB39Q9Y376 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CAB39Q9Y376 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CAB39Q9Y376 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CAB39Q9Y376 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CAB39Q9Y376 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CAB39Q9Y376 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CAB39Q9Y376 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CAB39Q9Y376 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CAB39Q9Y376 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CAB39Q9Y376 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CAB39Q9Y376 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CAB39Q9Y376 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CAB39Q9Y376 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CAB39Q9Y376 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CAB39Q9Y376 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CAB39Q9Y376 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CAB39Q9Y376 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CAB39Q9Y376 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CAB39Q9Y376 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CAB39Q9Y376 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CAB39Q9Y376 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CAB39Q9Y376 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CAB39Q9Y376 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CAB39Q9Y376 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CAB39Q9Y376 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CAB39Q9Y376 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CAB39Q9Y376 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CAB39Q9Y376 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CAB39Q9Y376 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CAB39Q9Y376 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CAB39Q9Y376 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CAB39Q9Y376 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CAB39Q9Y376 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CAB39Q9Y376 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CAB39Q9Y376 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CAB39Q9Y376 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms