Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYI0

PSD3, PH and SEC7 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSD3Q9NYI0 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSD3Q9NYI0 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSD3Q9NYI0 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSD3Q9NYI0 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSD3Q9NYI0 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSD3Q9NYI0 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSD3Q9NYI0 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSD3Q9NYI0 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSD3Q9NYI0 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSD3Q9NYI0 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSD3Q9NYI0 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PSD3Q9NYI0 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSD3Q9NYI0 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSD3Q9NYI0 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSD3Q9NYI0 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSD3Q9NYI0 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSD3Q9NYI0 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSD3Q9NYI0 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSD3Q9NYI0 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSD3Q9NYI0 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSD3Q9NYI0 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSD3Q9NYI0 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSD3Q9NYI0 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSD3Q9NYI0 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSD3Q9NYI0 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSD3Q9NYI0 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSD3Q9NYI0 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSD3Q9NYI0 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSD3Q9NYI0 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSD3Q9NYI0 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSD3Q9NYI0 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSD3Q9NYI0 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSD3Q9NYI0 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSD3Q9NYI0 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSD3Q9NYI0 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSD3Q9NYI0 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSD3Q9NYI0 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSD3Q9NYI0 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSD3Q9NYI0 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSD3Q9NYI0 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSD3Q9NYI0 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSD3Q9NYI0 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSD3Q9NYI0 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSD3Q9NYI0 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSD3Q9NYI0 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSD3Q9NYI0 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSD3Q9NYI0 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSD3Q9NYI0 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSD3Q9NYI0 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSD3Q9NYI0 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSD3Q9NYI0 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSD3Q9NYI0 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSD3Q9NYI0 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSD3Q9NYI0 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSD3Q9NYI0 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSD3Q9NYI0 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PSD3Q9NYI0 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSD3Q9NYI0 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSD3Q9NYI0 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSD3Q9NYI0 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSD3Q9NYI0 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSD3Q9NYI0 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSD3Q9NYI0 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSD3Q9NYI0 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSD3Q9NYI0 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSD3Q9NYI0 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSD3Q9NYI0 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSD3Q9NYI0 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSD3Q9NYI0 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSD3Q9NYI0 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSD3Q9NYI0 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSD3Q9NYI0 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSD3Q9NYI0 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSD3Q9NYI0 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSD3Q9NYI0 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSD3Q9NYI0 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSD3Q9NYI0 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSD3Q9NYI0 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSD3Q9NYI0 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSD3Q9NYI0 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSD3Q9NYI0 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PSD3Q9NYI0 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSD3Q9NYI0 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSD3Q9NYI0 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSD3Q9NYI0 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSD3Q9NYI0 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSD3Q9NYI0 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSD3Q9NYI0 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSD3Q9NYI0 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSD3Q9NYI0 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSD3Q9NYI0 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSD3Q9NYI0 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSD3Q9NYI0 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSD3Q9NYI0 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSD3Q9NYI0 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSD3Q9NYI0 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSD3Q9NYI0 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSD3Q9NYI0 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSD3Q9NYI0 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSD3Q9NYI0 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms