Protein–RNA interactions for Protein: Q9H875

PRKRIP1, PRKR-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKRIP1Q9H875 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRKRIP1Q9H875 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRKRIP1Q9H875 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRKRIP1Q9H875 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRKRIP1Q9H875 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRKRIP1Q9H875 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRKRIP1Q9H875 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRKRIP1Q9H875 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRKRIP1Q9H875 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRKRIP1Q9H875 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRKRIP1Q9H875 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
PRKRIP1Q9H875 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRKRIP1Q9H875 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRKRIP1Q9H875 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRKRIP1Q9H875 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRKRIP1Q9H875 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRKRIP1Q9H875 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRKRIP1Q9H875 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
PRKRIP1Q9H875 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRKRIP1Q9H875 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRKRIP1Q9H875 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRKRIP1Q9H875 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRKRIP1Q9H875 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRKRIP1Q9H875 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRKRIP1Q9H875 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRKRIP1Q9H875 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRKRIP1Q9H875 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRKRIP1Q9H875 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRKRIP1Q9H875 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRKRIP1Q9H875 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRKRIP1Q9H875 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
PRKRIP1Q9H875 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRKRIP1Q9H875 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
PRKRIP1Q9H875 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRKRIP1Q9H875 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRKRIP1Q9H875 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRKRIP1Q9H875 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRKRIP1Q9H875 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRKRIP1Q9H875 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRKRIP1Q9H875 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRKRIP1Q9H875 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRKRIP1Q9H875 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
PRKRIP1Q9H875 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRKRIP1Q9H875 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRKRIP1Q9H875 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRKRIP1Q9H875 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRKRIP1Q9H875 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRKRIP1Q9H875 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
PRKRIP1Q9H875 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRKRIP1Q9H875 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRKRIP1Q9H875 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRKRIP1Q9H875 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRKRIP1Q9H875 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PRKRIP1Q9H875 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PRKRIP1Q9H875 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PRKRIP1Q9H875 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PRKRIP1Q9H875 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PRKRIP1Q9H875 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PRKRIP1Q9H875 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PRKRIP1Q9H875 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PRKRIP1Q9H875 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PRKRIP1Q9H875 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PRKRIP1Q9H875 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PRKRIP1Q9H875 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PRKRIP1Q9H875 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PRKRIP1Q9H875 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PRKRIP1Q9H875 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PRKRIP1Q9H875 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PRKRIP1Q9H875 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PRKRIP1Q9H875 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRKRIP1Q9H875 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRKRIP1Q9H875 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRKRIP1Q9H875 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRKRIP1Q9H875 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRKRIP1Q9H875 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRKRIP1Q9H875 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRKRIP1Q9H875 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRKRIP1Q9H875 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
PRKRIP1Q9H875 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRKRIP1Q9H875 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRKRIP1Q9H875 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRKRIP1Q9H875 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRKRIP1Q9H875 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRKRIP1Q9H875 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRKRIP1Q9H875 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRKRIP1Q9H875 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRKRIP1Q9H875 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
PRKRIP1Q9H875 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRKRIP1Q9H875 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRKRIP1Q9H875 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRKRIP1Q9H875 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRKRIP1Q9H875 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRKRIP1Q9H875 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRKRIP1Q9H875 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRKRIP1Q9H875 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRKRIP1Q9H875 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRKRIP1Q9H875 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRKRIP1Q9H875 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRKRIP1Q9H875 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRKRIP1Q9H875 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms