Protein–RNA interactions for Protein: Q9H204

MED28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED28Q9H204 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MED28Q9H204 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MED28Q9H204 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MED28Q9H204 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MED28Q9H204 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MED28Q9H204 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MED28Q9H204 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MED28Q9H204 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MED28Q9H204 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MED28Q9H204 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MED28Q9H204 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
MED28Q9H204 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MED28Q9H204 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MED28Q9H204 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MED28Q9H204 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MED28Q9H204 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MED28Q9H204 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MED28Q9H204 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MED28Q9H204 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
MED28Q9H204 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MED28Q9H204 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MED28Q9H204 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MED28Q9H204 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MED28Q9H204 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MED28Q9H204 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MED28Q9H204 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MED28Q9H204 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MED28Q9H204 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MED28Q9H204 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MED28Q9H204 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
MED28Q9H204 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MED28Q9H204 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MED28Q9H204 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MED28Q9H204 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MED28Q9H204 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MED28Q9H204 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MED28Q9H204 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
MED28Q9H204 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MED28Q9H204 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MED28Q9H204 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MED28Q9H204 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MED28Q9H204 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MED28Q9H204 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MED28Q9H204 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MED28Q9H204 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MED28Q9H204 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MED28Q9H204 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MED28Q9H204 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MED28Q9H204 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MED28Q9H204 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MED28Q9H204 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MED28Q9H204 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MED28Q9H204 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MED28Q9H204 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MED28Q9H204 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MED28Q9H204 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MED28Q9H204 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MED28Q9H204 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MED28Q9H204 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MED28Q9H204 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MED28Q9H204 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MED28Q9H204 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MED28Q9H204 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MED28Q9H204 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MED28Q9H204 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MED28Q9H204 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MED28Q9H204 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MED28Q9H204 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MED28Q9H204 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MED28Q9H204 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MED28Q9H204 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MED28Q9H204 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MED28Q9H204 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MED28Q9H204 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MED28Q9H204 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MED28Q9H204 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MED28Q9H204 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MED28Q9H204 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MED28Q9H204 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MED28Q9H204 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MED28Q9H204 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MED28Q9H204 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MED28Q9H204 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MED28Q9H204 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MED28Q9H204 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MED28Q9H204 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MED28Q9H204 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MED28Q9H204 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MED28Q9H204 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MED28Q9H204 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MED28Q9H204 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MED28Q9H204 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MED28Q9H204 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MED28Q9H204 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MED28Q9H204 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MED28Q9H204 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MED28Q9H204 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MED28Q9H204 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MED28Q9H204 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MED28Q9H204 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms