Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0F6

SHARPIN, Sharpin, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHARPINQ9H0F6 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SHARPINQ9H0F6 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SHARPINQ9H0F6 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SHARPINQ9H0F6 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SHARPINQ9H0F6 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SHARPINQ9H0F6 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SHARPINQ9H0F6 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SHARPINQ9H0F6 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SHARPINQ9H0F6 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SHARPINQ9H0F6 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SHARPINQ9H0F6 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SHARPINQ9H0F6 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SHARPINQ9H0F6 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SHARPINQ9H0F6 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SHARPINQ9H0F6 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SHARPINQ9H0F6 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SHARPINQ9H0F6 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SHARPINQ9H0F6 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SHARPINQ9H0F6 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SHARPINQ9H0F6 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SHARPINQ9H0F6 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SHARPINQ9H0F6 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SHARPINQ9H0F6 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SHARPINQ9H0F6 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SHARPINQ9H0F6 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SHARPINQ9H0F6 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SHARPINQ9H0F6 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SHARPINQ9H0F6 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SHARPINQ9H0F6 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SHARPINQ9H0F6 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SHARPINQ9H0F6 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SHARPINQ9H0F6 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SHARPINQ9H0F6 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SHARPINQ9H0F6 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SHARPINQ9H0F6 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SHARPINQ9H0F6 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SHARPINQ9H0F6 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SHARPINQ9H0F6 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SHARPINQ9H0F6 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SHARPINQ9H0F6 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SHARPINQ9H0F6 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SHARPINQ9H0F6 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SHARPINQ9H0F6 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SHARPINQ9H0F6 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SHARPINQ9H0F6 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SHARPINQ9H0F6 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SHARPINQ9H0F6 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SHARPINQ9H0F6 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SHARPINQ9H0F6 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SHARPINQ9H0F6 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SHARPINQ9H0F6 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SHARPINQ9H0F6 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SHARPINQ9H0F6 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SHARPINQ9H0F6 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SHARPINQ9H0F6 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SHARPINQ9H0F6 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SHARPINQ9H0F6 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SHARPINQ9H0F6 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SHARPINQ9H0F6 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SHARPINQ9H0F6 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SHARPINQ9H0F6 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SHARPINQ9H0F6 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SHARPINQ9H0F6 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SHARPINQ9H0F6 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SHARPINQ9H0F6 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SHARPINQ9H0F6 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SHARPINQ9H0F6 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SHARPINQ9H0F6 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SHARPINQ9H0F6 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SHARPINQ9H0F6 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SHARPINQ9H0F6 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SHARPINQ9H0F6 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SHARPINQ9H0F6 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SHARPINQ9H0F6 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SHARPINQ9H0F6 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SHARPINQ9H0F6 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SHARPINQ9H0F6 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SHARPINQ9H0F6 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SHARPINQ9H0F6 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SHARPINQ9H0F6 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SHARPINQ9H0F6 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SHARPINQ9H0F6 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SHARPINQ9H0F6 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SHARPINQ9H0F6 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SHARPINQ9H0F6 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SHARPINQ9H0F6 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SHARPINQ9H0F6 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SHARPINQ9H0F6 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SHARPINQ9H0F6 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SHARPINQ9H0F6 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SHARPINQ9H0F6 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SHARPINQ9H0F6 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SHARPINQ9H0F6 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SHARPINQ9H0F6 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SHARPINQ9H0F6 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SHARPINQ9H0F6 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SHARPINQ9H0F6 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SHARPINQ9H0F6 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SHARPINQ9H0F6 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SHARPINQ9H0F6 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms