Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZQ6

EDEM3, ER degradation-enhancing alpha-mannosidase-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDEM3Q9BZQ6 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EDEM3Q9BZQ6 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EDEM3Q9BZQ6 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EDEM3Q9BZQ6 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EDEM3Q9BZQ6 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EDEM3Q9BZQ6 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EDEM3Q9BZQ6 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EDEM3Q9BZQ6 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EDEM3Q9BZQ6 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EDEM3Q9BZQ6 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EDEM3Q9BZQ6 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
EDEM3Q9BZQ6 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EDEM3Q9BZQ6 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EDEM3Q9BZQ6 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EDEM3Q9BZQ6 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EDEM3Q9BZQ6 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EDEM3Q9BZQ6 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EDEM3Q9BZQ6 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EDEM3Q9BZQ6 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
EDEM3Q9BZQ6 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EDEM3Q9BZQ6 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EDEM3Q9BZQ6 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EDEM3Q9BZQ6 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EDEM3Q9BZQ6 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EDEM3Q9BZQ6 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EDEM3Q9BZQ6 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EDEM3Q9BZQ6 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EDEM3Q9BZQ6 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EDEM3Q9BZQ6 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EDEM3Q9BZQ6 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EDEM3Q9BZQ6 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EDEM3Q9BZQ6 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EDEM3Q9BZQ6 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EDEM3Q9BZQ6 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
EDEM3Q9BZQ6 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EDEM3Q9BZQ6 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EDEM3Q9BZQ6 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EDEM3Q9BZQ6 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EDEM3Q9BZQ6 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EDEM3Q9BZQ6 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EDEM3Q9BZQ6 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EDEM3Q9BZQ6 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EDEM3Q9BZQ6 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EDEM3Q9BZQ6 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EDEM3Q9BZQ6 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EDEM3Q9BZQ6 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EDEM3Q9BZQ6 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EDEM3Q9BZQ6 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EDEM3Q9BZQ6 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EDEM3Q9BZQ6 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EDEM3Q9BZQ6 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EDEM3Q9BZQ6 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EDEM3Q9BZQ6 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EDEM3Q9BZQ6 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EDEM3Q9BZQ6 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EDEM3Q9BZQ6 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EDEM3Q9BZQ6 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EDEM3Q9BZQ6 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EDEM3Q9BZQ6 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EDEM3Q9BZQ6 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EDEM3Q9BZQ6 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EDEM3Q9BZQ6 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EDEM3Q9BZQ6 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EDEM3Q9BZQ6 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EDEM3Q9BZQ6 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
EDEM3Q9BZQ6 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EDEM3Q9BZQ6 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EDEM3Q9BZQ6 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EDEM3Q9BZQ6 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EDEM3Q9BZQ6 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
EDEM3Q9BZQ6 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EDEM3Q9BZQ6 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
EDEM3Q9BZQ6 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EDEM3Q9BZQ6 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EDEM3Q9BZQ6 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
EDEM3Q9BZQ6 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EDEM3Q9BZQ6 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EDEM3Q9BZQ6 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EDEM3Q9BZQ6 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EDEM3Q9BZQ6 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EDEM3Q9BZQ6 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
EDEM3Q9BZQ6 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EDEM3Q9BZQ6 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EDEM3Q9BZQ6 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EDEM3Q9BZQ6 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EDEM3Q9BZQ6 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EDEM3Q9BZQ6 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EDEM3Q9BZQ6 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EDEM3Q9BZQ6 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EDEM3Q9BZQ6 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EDEM3Q9BZQ6 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EDEM3Q9BZQ6 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EDEM3Q9BZQ6 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EDEM3Q9BZQ6 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EDEM3Q9BZQ6 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EDEM3Q9BZQ6 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EDEM3Q9BZQ6 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EDEM3Q9BZQ6 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EDEM3Q9BZQ6 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EDEM3Q9BZQ6 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms