Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZNG9

KRBA2, KRAB-A domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRBA2Q6ZNG9 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRBA2Q6ZNG9 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRBA2Q6ZNG9 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRBA2Q6ZNG9 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRBA2Q6ZNG9 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRBA2Q6ZNG9 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
KRBA2Q6ZNG9 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRBA2Q6ZNG9 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRBA2Q6ZNG9 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRBA2Q6ZNG9 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRBA2Q6ZNG9 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRBA2Q6ZNG9 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRBA2Q6ZNG9 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRBA2Q6ZNG9 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRBA2Q6ZNG9 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRBA2Q6ZNG9 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRBA2Q6ZNG9 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRBA2Q6ZNG9 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
KRBA2Q6ZNG9 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRBA2Q6ZNG9 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KRBA2Q6ZNG9 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KRBA2Q6ZNG9 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
KRBA2Q6ZNG9 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
KRBA2Q6ZNG9 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
KRBA2Q6ZNG9 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KRBA2Q6ZNG9 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KRBA2Q6ZNG9 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
KRBA2Q6ZNG9 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRBA2Q6ZNG9 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRBA2Q6ZNG9 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRBA2Q6ZNG9 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRBA2Q6ZNG9 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRBA2Q6ZNG9 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRBA2Q6ZNG9 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRBA2Q6ZNG9 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
KRBA2Q6ZNG9 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRBA2Q6ZNG9 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRBA2Q6ZNG9 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRBA2Q6ZNG9 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRBA2Q6ZNG9 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRBA2Q6ZNG9 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRBA2Q6ZNG9 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRBA2Q6ZNG9 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRBA2Q6ZNG9 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRBA2Q6ZNG9 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRBA2Q6ZNG9 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRBA2Q6ZNG9 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRBA2Q6ZNG9 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRBA2Q6ZNG9 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
KRBA2Q6ZNG9 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRBA2Q6ZNG9 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRBA2Q6ZNG9 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRBA2Q6ZNG9 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRBA2Q6ZNG9 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRBA2Q6ZNG9 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRBA2Q6ZNG9 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRBA2Q6ZNG9 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRBA2Q6ZNG9 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRBA2Q6ZNG9 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRBA2Q6ZNG9 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
KRBA2Q6ZNG9 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRBA2Q6ZNG9 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRBA2Q6ZNG9 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRBA2Q6ZNG9 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRBA2Q6ZNG9 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRBA2Q6ZNG9 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRBA2Q6ZNG9 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
KRBA2Q6ZNG9 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRBA2Q6ZNG9 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRBA2Q6ZNG9 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRBA2Q6ZNG9 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRBA2Q6ZNG9 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
KRBA2Q6ZNG9 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRBA2Q6ZNG9 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRBA2Q6ZNG9 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRBA2Q6ZNG9 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRBA2Q6ZNG9 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRBA2Q6ZNG9 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRBA2Q6ZNG9 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRBA2Q6ZNG9 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRBA2Q6ZNG9 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRBA2Q6ZNG9 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
KRBA2Q6ZNG9 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRBA2Q6ZNG9 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRBA2Q6ZNG9 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRBA2Q6ZNG9 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRBA2Q6ZNG9 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRBA2Q6ZNG9 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRBA2Q6ZNG9 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRBA2Q6ZNG9 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRBA2Q6ZNG9 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRBA2Q6ZNG9 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRBA2Q6ZNG9 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRBA2Q6ZNG9 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRBA2Q6ZNG9 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRBA2Q6ZNG9 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRBA2Q6ZNG9 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRBA2Q6ZNG9 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRBA2Q6ZNG9 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRBA2Q6ZNG9 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms