Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC173Q0VFZ6 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC173Q0VFZ6 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC173Q0VFZ6 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC173Q0VFZ6 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC173Q0VFZ6 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC173Q0VFZ6 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC173Q0VFZ6 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC173Q0VFZ6 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC173Q0VFZ6 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC173Q0VFZ6 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC173Q0VFZ6 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC173Q0VFZ6 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC173Q0VFZ6 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC173Q0VFZ6 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC173Q0VFZ6 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC173Q0VFZ6 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC173Q0VFZ6 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC173Q0VFZ6 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC173Q0VFZ6 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC173Q0VFZ6 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC173Q0VFZ6 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC173Q0VFZ6 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC173Q0VFZ6 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC173Q0VFZ6 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC173Q0VFZ6 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC173Q0VFZ6 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC173Q0VFZ6 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC173Q0VFZ6 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC173Q0VFZ6 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC173Q0VFZ6 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC173Q0VFZ6 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC173Q0VFZ6 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC173Q0VFZ6 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC173Q0VFZ6 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC173Q0VFZ6 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC173Q0VFZ6 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC173Q0VFZ6 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC173Q0VFZ6 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC173Q0VFZ6 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC173Q0VFZ6 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC173Q0VFZ6 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC173Q0VFZ6 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC173Q0VFZ6 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC173Q0VFZ6 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC173Q0VFZ6 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC173Q0VFZ6 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC173Q0VFZ6 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC173Q0VFZ6 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC173Q0VFZ6 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC173Q0VFZ6 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC173Q0VFZ6 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC173Q0VFZ6 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC173Q0VFZ6 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC173Q0VFZ6 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC173Q0VFZ6 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC173Q0VFZ6 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC173Q0VFZ6 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC173Q0VFZ6 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC173Q0VFZ6 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC173Q0VFZ6 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC173Q0VFZ6 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC173Q0VFZ6 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC173Q0VFZ6 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC173Q0VFZ6 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC173Q0VFZ6 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC173Q0VFZ6 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC173Q0VFZ6 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC173Q0VFZ6 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC173Q0VFZ6 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC173Q0VFZ6 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC173Q0VFZ6 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC173Q0VFZ6 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC173Q0VFZ6 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC173Q0VFZ6 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC173Q0VFZ6 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC173Q0VFZ6 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC173Q0VFZ6 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC173Q0VFZ6 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC173Q0VFZ6 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC173Q0VFZ6 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC173Q0VFZ6 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC173Q0VFZ6 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC173Q0VFZ6 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC173Q0VFZ6 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC173Q0VFZ6 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC173Q0VFZ6 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC173Q0VFZ6 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC173Q0VFZ6 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC173Q0VFZ6 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC173Q0VFZ6 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC173Q0VFZ6 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC173Q0VFZ6 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC173Q0VFZ6 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC173Q0VFZ6 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC173Q0VFZ6 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC173Q0VFZ6 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC173Q0VFZ6 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC173Q0VFZ6 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC173Q0VFZ6 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms