Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
UBE3AQ05086 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
UBE3AQ05086 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
UBE3AQ05086 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
UBE3AQ05086 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
UBE3AQ05086 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
UBE3AQ05086 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
UBE3AQ05086 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
UBE3AQ05086 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
UBE3AQ05086 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
UBE3AQ05086 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
UBE3AQ05086 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
UBE3AQ05086 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
UBE3AQ05086 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
UBE3AQ05086 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
UBE3AQ05086 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
UBE3AQ05086 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
UBE3AQ05086 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
UBE3AQ05086 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
UBE3AQ05086 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
UBE3AQ05086 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
UBE3AQ05086 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
UBE3AQ05086 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
UBE3AQ05086 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
UBE3AQ05086 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
UBE3AQ05086 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
UBE3AQ05086 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
UBE3AQ05086 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
UBE3AQ05086 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
UBE3AQ05086 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
UBE3AQ05086 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
UBE3AQ05086 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
UBE3AQ05086 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
UBE3AQ05086 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
UBE3AQ05086 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
UBE3AQ05086 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
UBE3AQ05086 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
UBE3AQ05086 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
UBE3AQ05086 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
UBE3AQ05086 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
UBE3AQ05086 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
UBE3AQ05086 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
UBE3AQ05086 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
UBE3AQ05086 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
UBE3AQ05086 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
UBE3AQ05086 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
UBE3AQ05086 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
UBE3AQ05086 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
UBE3AQ05086 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
UBE3AQ05086 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
UBE3AQ05086 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
UBE3AQ05086 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
UBE3AQ05086 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
UBE3AQ05086 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
UBE3AQ05086 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
UBE3AQ05086 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
UBE3AQ05086 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
UBE3AQ05086 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
UBE3AQ05086 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
UBE3AQ05086 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
UBE3AQ05086 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
UBE3AQ05086 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
UBE3AQ05086 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
UBE3AQ05086 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
UBE3AQ05086 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
UBE3AQ05086 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
UBE3AQ05086 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
UBE3AQ05086 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
UBE3AQ05086 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
UBE3AQ05086 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
UBE3AQ05086 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
UBE3AQ05086 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
UBE3AQ05086 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
UBE3AQ05086 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
UBE3AQ05086 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
UBE3AQ05086 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
UBE3AQ05086 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
UBE3AQ05086 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
UBE3AQ05086 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
UBE3AQ05086 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
UBE3AQ05086 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
UBE3AQ05086 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
UBE3AQ05086 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
UBE3AQ05086 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
UBE3AQ05086 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
UBE3AQ05086 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
UBE3AQ05086 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
UBE3AQ05086 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
UBE3AQ05086 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
UBE3AQ05086 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
UBE3AQ05086 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
UBE3AQ05086 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
UBE3AQ05086 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
UBE3AQ05086 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
UBE3AQ05086 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
UBE3AQ05086 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
UBE3AQ05086 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
UBE3AQ05086 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
UBE3AQ05086 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
UBE3AQ05086 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms