Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GJB2P29033 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GJB2P29033 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GJB2P29033 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GJB2P29033 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GJB2P29033 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GJB2P29033 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
GJB2P29033 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GJB2P29033 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GJB2P29033 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GJB2P29033 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GJB2P29033 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GJB2P29033 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GJB2P29033 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GJB2P29033 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GJB2P29033 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GJB2P29033 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GJB2P29033 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GJB2P29033 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
GJB2P29033 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
GJB2P29033 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GJB2P29033 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GJB2P29033 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GJB2P29033 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GJB2P29033 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GJB2P29033 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
GJB2P29033 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GJB2P29033 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GJB2P29033 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GJB2P29033 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GJB2P29033 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GJB2P29033 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GJB2P29033 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GJB2P29033 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GJB2P29033 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GJB2P29033 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GJB2P29033 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GJB2P29033 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
GJB2P29033 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GJB2P29033 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GJB2P29033 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GJB2P29033 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GJB2P29033 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GJB2P29033 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GJB2P29033 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GJB2P29033 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
GJB2P29033 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GJB2P29033 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GJB2P29033 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GJB2P29033 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GJB2P29033 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GJB2P29033 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GJB2P29033 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GJB2P29033 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GJB2P29033 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GJB2P29033 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GJB2P29033 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
GJB2P29033 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GJB2P29033 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GJB2P29033 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GJB2P29033 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GJB2P29033 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GJB2P29033 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GJB2P29033 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
GJB2P29033 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GJB2P29033 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GJB2P29033 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GJB2P29033 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GJB2P29033 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJB2P29033 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJB2P29033 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJB2P29033 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJB2P29033 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJB2P29033 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJB2P29033 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
GJB2P29033 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJB2P29033 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJB2P29033 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJB2P29033 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJB2P29033 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJB2P29033 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJB2P29033 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJB2P29033 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJB2P29033 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJB2P29033 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GJB2P29033 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GJB2P29033 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GJB2P29033 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GJB2P29033 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GJB2P29033 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GJB2P29033 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GJB2P29033 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
GJB2P29033 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
GJB2P29033 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GJB2P29033 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GJB2P29033 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GJB2P29033 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GJB2P29033 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GJB2P29033 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GJB2P29033 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms