Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPREP23469 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPREP23469 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPREP23469 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPREP23469 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPREP23469 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPREP23469 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPREP23469 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPREP23469 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPREP23469 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPREP23469 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPREP23469 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPREP23469 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPREP23469 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPREP23469 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPREP23469 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPREP23469 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPREP23469 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPREP23469 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPREP23469 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPREP23469 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPREP23469 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPREP23469 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPREP23469 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPREP23469 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPREP23469 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPREP23469 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPREP23469 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPREP23469 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPREP23469 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPREP23469 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPREP23469 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPREP23469 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPREP23469 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPREP23469 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPREP23469 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPREP23469 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPREP23469 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPREP23469 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPREP23469 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPREP23469 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPREP23469 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PTPREP23469 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPREP23469 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PTPREP23469 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPREP23469 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPREP23469 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
PTPREP23469 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PTPREP23469 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PTPREP23469 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPREP23469 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PTPREP23469 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PTPREP23469 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPREP23469 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPREP23469 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PTPREP23469 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPREP23469 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPREP23469 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPREP23469 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPREP23469 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPREP23469 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPREP23469 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPREP23469 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPREP23469 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPREP23469 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPREP23469 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPREP23469 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPREP23469 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPREP23469 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPREP23469 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPREP23469 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPREP23469 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPREP23469 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPREP23469 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPREP23469 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPREP23469 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPREP23469 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPREP23469 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPREP23469 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPREP23469 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPREP23469 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPREP23469 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPREP23469 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPREP23469 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPREP23469 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPREP23469 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPREP23469 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPREP23469 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPREP23469 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPREP23469 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPREP23469 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPREP23469 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPREP23469 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPREP23469 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPREP23469 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPREP23469 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPREP23469 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPREP23469 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPREP23469 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPREP23469 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
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