Protein–RNA interactions for Protein: P21860

ERBB3, Receptor tyrosine-protein kinase erbB-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERBB3P21860 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ERBB3P21860 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ERBB3P21860 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ERBB3P21860 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ERBB3P21860 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ERBB3P21860 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ERBB3P21860 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ERBB3P21860 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
ERBB3P21860 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
ERBB3P21860 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
ERBB3P21860 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
ERBB3P21860 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ERBB3P21860 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ERBB3P21860 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ERBB3P21860 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ERBB3P21860 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ERBB3P21860 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ERBB3P21860 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ERBB3P21860 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ERBB3P21860 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ERBB3P21860 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ERBB3P21860 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ERBB3P21860 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ERBB3P21860 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ERBB3P21860 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ERBB3P21860 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ERBB3P21860 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ERBB3P21860 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ERBB3P21860 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ERBB3P21860 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ERBB3P21860 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ERBB3P21860 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ERBB3P21860 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ERBB3P21860 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ERBB3P21860 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ERBB3P21860 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ERBB3P21860 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ERBB3P21860 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ERBB3P21860 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ERBB3P21860 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ERBB3P21860 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ERBB3P21860 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ERBB3P21860 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ERBB3P21860 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ERBB3P21860 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ERBB3P21860 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ERBB3P21860 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ERBB3P21860 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ERBB3P21860 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ERBB3P21860 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ERBB3P21860 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ERBB3P21860 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ERBB3P21860 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ERBB3P21860 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ERBB3P21860 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ERBB3P21860 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ERBB3P21860 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ERBB3P21860 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ERBB3P21860 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ERBB3P21860 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ERBB3P21860 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ERBB3P21860 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ERBB3P21860 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ERBB3P21860 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ERBB3P21860 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ERBB3P21860 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
ERBB3P21860 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ERBB3P21860 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ERBB3P21860 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ERBB3P21860 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ERBB3P21860 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ERBB3P21860 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ERBB3P21860 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ERBB3P21860 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ERBB3P21860 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ERBB3P21860 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ERBB3P21860 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ERBB3P21860 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ERBB3P21860 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ERBB3P21860 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ERBB3P21860 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ERBB3P21860 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
ERBB3P21860 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ERBB3P21860 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ERBB3P21860 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ERBB3P21860 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ERBB3P21860 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ERBB3P21860 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ERBB3P21860 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ERBB3P21860 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ERBB3P21860 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ERBB3P21860 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ERBB3P21860 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ERBB3P21860 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ERBB3P21860 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ERBB3P21860 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ERBB3P21860 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ERBB3P21860 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ERBB3P21860 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ERBB3P21860 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms