Protein–RNA interactions for Protein: P16615

ATP2A2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A2P16615 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP2A2P16615 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP2A2P16615 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP2A2P16615 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP2A2P16615 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP2A2P16615 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP2A2P16615 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP2A2P16615 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP2A2P16615 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP2A2P16615 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP2A2P16615 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP2A2P16615 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP2A2P16615 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP2A2P16615 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP2A2P16615 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP2A2P16615 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP2A2P16615 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
ATP2A2P16615 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP2A2P16615 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP2A2P16615 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP2A2P16615 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP2A2P16615 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP2A2P16615 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP2A2P16615 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP2A2P16615 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP2A2P16615 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP2A2P16615 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP2A2P16615 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP2A2P16615 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP2A2P16615 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP2A2P16615 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP2A2P16615 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP2A2P16615 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP2A2P16615 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP2A2P16615 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP2A2P16615 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP2A2P16615 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP2A2P16615 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP2A2P16615 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP2A2P16615 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP2A2P16615 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP2A2P16615 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP2A2P16615 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP2A2P16615 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP2A2P16615 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP2A2P16615 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP2A2P16615 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP2A2P16615 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP2A2P16615 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP2A2P16615 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP2A2P16615 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP2A2P16615 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP2A2P16615 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP2A2P16615 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP2A2P16615 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP2A2P16615 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP2A2P16615 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP2A2P16615 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP2A2P16615 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP2A2P16615 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP2A2P16615 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP2A2P16615 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP2A2P16615 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP2A2P16615 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP2A2P16615 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP2A2P16615 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP2A2P16615 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP2A2P16615 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP2A2P16615 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP2A2P16615 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP2A2P16615 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP2A2P16615 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP2A2P16615 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP2A2P16615 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP2A2P16615 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP2A2P16615 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP2A2P16615 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP2A2P16615 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP2A2P16615 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP2A2P16615 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP2A2P16615 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP2A2P16615 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP2A2P16615 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP2A2P16615 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP2A2P16615 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP2A2P16615 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP2A2P16615 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP2A2P16615 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP2A2P16615 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP2A2P16615 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP2A2P16615 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP2A2P16615 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP2A2P16615 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP2A2P16615 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP2A2P16615 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP2A2P16615 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP2A2P16615 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP2A2P16615 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP2A2P16615 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP2A2P16615 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms