Protein–RNA interactions for Protein: P02647

APOA1, Apolipoprotein A-I, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA1P02647 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOA1P02647 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
APOA1P02647 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOA1P02647 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
APOA1P02647 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOA1P02647 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOA1P02647 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOA1P02647 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOA1P02647 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOA1P02647 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOA1P02647 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOA1P02647 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOA1P02647 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOA1P02647 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOA1P02647 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOA1P02647 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
APOA1P02647 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOA1P02647 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOA1P02647 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOA1P02647 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOA1P02647 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
APOA1P02647 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOA1P02647 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOA1P02647 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOA1P02647 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOA1P02647 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOA1P02647 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOA1P02647 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOA1P02647 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
APOA1P02647 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
APOA1P02647 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
APOA1P02647 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
APOA1P02647 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
APOA1P02647 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
APOA1P02647 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
APOA1P02647 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
APOA1P02647 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
APOA1P02647 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
APOA1P02647 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
APOA1P02647 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOA1P02647 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOA1P02647 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOA1P02647 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOA1P02647 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOA1P02647 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOA1P02647 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOA1P02647 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOA1P02647 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
APOA1P02647 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
APOA1P02647 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOA1P02647 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOA1P02647 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOA1P02647 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOA1P02647 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOA1P02647 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOA1P02647 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOA1P02647 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOA1P02647 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOA1P02647 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOA1P02647 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOA1P02647 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOA1P02647 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOA1P02647 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOA1P02647 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOA1P02647 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
APOA1P02647 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOA1P02647 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOA1P02647 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOA1P02647 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOA1P02647 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOA1P02647 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOA1P02647 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
APOA1P02647 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOA1P02647 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOA1P02647 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOA1P02647 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOA1P02647 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOA1P02647 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOA1P02647 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOA1P02647 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOA1P02647 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOA1P02647 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOA1P02647 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOA1P02647 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOA1P02647 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOA1P02647 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOA1P02647 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOA1P02647 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOA1P02647 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOA1P02647 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOA1P02647 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOA1P02647 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOA1P02647 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOA1P02647 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOA1P02647 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOA1P02647 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOA1P02647 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOA1P02647 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOA1P02647 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
APOA1P02647 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms