Protein–RNA interactions for Protein: O75822

EIF3J, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit J, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3JO75822 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EIF3JO75822 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EIF3JO75822 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EIF3JO75822 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EIF3JO75822 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EIF3JO75822 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EIF3JO75822 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EIF3JO75822 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
EIF3JO75822 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
EIF3JO75822 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EIF3JO75822 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EIF3JO75822 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EIF3JO75822 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EIF3JO75822 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EIF3JO75822 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EIF3JO75822 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EIF3JO75822 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EIF3JO75822 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
EIF3JO75822 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EIF3JO75822 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EIF3JO75822 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EIF3JO75822 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EIF3JO75822 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EIF3JO75822 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
EIF3JO75822 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
EIF3JO75822 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EIF3JO75822 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EIF3JO75822 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EIF3JO75822 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EIF3JO75822 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EIF3JO75822 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EIF3JO75822 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EIF3JO75822 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EIF3JO75822 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EIF3JO75822 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EIF3JO75822 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EIF3JO75822 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EIF3JO75822 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EIF3JO75822 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
EIF3JO75822 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EIF3JO75822 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EIF3JO75822 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EIF3JO75822 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EIF3JO75822 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EIF3JO75822 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EIF3JO75822 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EIF3JO75822 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EIF3JO75822 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EIF3JO75822 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EIF3JO75822 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EIF3JO75822 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EIF3JO75822 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EIF3JO75822 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EIF3JO75822 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EIF3JO75822 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EIF3JO75822 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EIF3JO75822 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EIF3JO75822 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EIF3JO75822 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EIF3JO75822 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
EIF3JO75822 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EIF3JO75822 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EIF3JO75822 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EIF3JO75822 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EIF3JO75822 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EIF3JO75822 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
EIF3JO75822 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EIF3JO75822 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EIF3JO75822 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EIF3JO75822 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EIF3JO75822 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EIF3JO75822 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EIF3JO75822 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EIF3JO75822 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EIF3JO75822 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EIF3JO75822 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EIF3JO75822 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EIF3JO75822 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EIF3JO75822 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EIF3JO75822 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EIF3JO75822 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
EIF3JO75822 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EIF3JO75822 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EIF3JO75822 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
EIF3JO75822 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EIF3JO75822 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EIF3JO75822 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EIF3JO75822 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EIF3JO75822 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EIF3JO75822 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EIF3JO75822 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EIF3JO75822 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EIF3JO75822 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EIF3JO75822 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EIF3JO75822 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EIF3JO75822 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EIF3JO75822 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EIF3JO75822 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EIF3JO75822 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EIF3JO75822 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms