Protein–RNA interactions for Protein: A4D1S5

RAB19, Ras-related protein Rab-19, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB19A4D1S5 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB19A4D1S5 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB19A4D1S5 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB19A4D1S5 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB19A4D1S5 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB19A4D1S5 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB19A4D1S5 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB19A4D1S5 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB19A4D1S5 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB19A4D1S5 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB19A4D1S5 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB19A4D1S5 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB19A4D1S5 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB19A4D1S5 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB19A4D1S5 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB19A4D1S5 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB19A4D1S5 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB19A4D1S5 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB19A4D1S5 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB19A4D1S5 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB19A4D1S5 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB19A4D1S5 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB19A4D1S5 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB19A4D1S5 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB19A4D1S5 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB19A4D1S5 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB19A4D1S5 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB19A4D1S5 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB19A4D1S5 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB19A4D1S5 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB19A4D1S5 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB19A4D1S5 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB19A4D1S5 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB19A4D1S5 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB19A4D1S5 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB19A4D1S5 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB19A4D1S5 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB19A4D1S5 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB19A4D1S5 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB19A4D1S5 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB19A4D1S5 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB19A4D1S5 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB19A4D1S5 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB19A4D1S5 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB19A4D1S5 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB19A4D1S5 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB19A4D1S5 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB19A4D1S5 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB19A4D1S5 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB19A4D1S5 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB19A4D1S5 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB19A4D1S5 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB19A4D1S5 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB19A4D1S5 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB19A4D1S5 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB19A4D1S5 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB19A4D1S5 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB19A4D1S5 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB19A4D1S5 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB19A4D1S5 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB19A4D1S5 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB19A4D1S5 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB19A4D1S5 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB19A4D1S5 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB19A4D1S5 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB19A4D1S5 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB19A4D1S5 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB19A4D1S5 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB19A4D1S5 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB19A4D1S5 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB19A4D1S5 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB19A4D1S5 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB19A4D1S5 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB19A4D1S5 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB19A4D1S5 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB19A4D1S5 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB19A4D1S5 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB19A4D1S5 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB19A4D1S5 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB19A4D1S5 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB19A4D1S5 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB19A4D1S5 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB19A4D1S5 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB19A4D1S5 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB19A4D1S5 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB19A4D1S5 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB19A4D1S5 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB19A4D1S5 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB19A4D1S5 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB19A4D1S5 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB19A4D1S5 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB19A4D1S5 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB19A4D1S5 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB19A4D1S5 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB19A4D1S5 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB19A4D1S5 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB19A4D1S5 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB19A4D1S5 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB19A4D1S5 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB19A4D1S5 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms