Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
E2F8A0AVK6 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
E2F8A0AVK6 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
E2F8A0AVK6 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
E2F8A0AVK6 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
E2F8A0AVK6 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
E2F8A0AVK6 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
E2F8A0AVK6 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
E2F8A0AVK6 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
E2F8A0AVK6 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
E2F8A0AVK6 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
E2F8A0AVK6 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
E2F8A0AVK6 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
E2F8A0AVK6 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
E2F8A0AVK6 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
E2F8A0AVK6 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
E2F8A0AVK6 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
E2F8A0AVK6 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
E2F8A0AVK6 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
E2F8A0AVK6 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
E2F8A0AVK6 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
E2F8A0AVK6 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
E2F8A0AVK6 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
E2F8A0AVK6 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
E2F8A0AVK6 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
E2F8A0AVK6 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
E2F8A0AVK6 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
E2F8A0AVK6 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
E2F8A0AVK6 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
E2F8A0AVK6 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
E2F8A0AVK6 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
E2F8A0AVK6 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
E2F8A0AVK6 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
E2F8A0AVK6 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
E2F8A0AVK6 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
E2F8A0AVK6 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
E2F8A0AVK6 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
E2F8A0AVK6 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
E2F8A0AVK6 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
E2F8A0AVK6 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
E2F8A0AVK6 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
E2F8A0AVK6 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
E2F8A0AVK6 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
E2F8A0AVK6 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
E2F8A0AVK6 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
E2F8A0AVK6 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
E2F8A0AVK6 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
E2F8A0AVK6 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
E2F8A0AVK6 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
E2F8A0AVK6 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
E2F8A0AVK6 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
E2F8A0AVK6 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
E2F8A0AVK6 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
E2F8A0AVK6 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
E2F8A0AVK6 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
E2F8A0AVK6 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
E2F8A0AVK6 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
E2F8A0AVK6 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
E2F8A0AVK6 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
E2F8A0AVK6 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
E2F8A0AVK6 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
E2F8A0AVK6 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
E2F8A0AVK6 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
E2F8A0AVK6 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
E2F8A0AVK6 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
E2F8A0AVK6 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
E2F8A0AVK6 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
E2F8A0AVK6 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
E2F8A0AVK6 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
E2F8A0AVK6 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
E2F8A0AVK6 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
E2F8A0AVK6 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
E2F8A0AVK6 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
E2F8A0AVK6 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
E2F8A0AVK6 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
E2F8A0AVK6 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
E2F8A0AVK6 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
E2F8A0AVK6 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
E2F8A0AVK6 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
E2F8A0AVK6 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
E2F8A0AVK6 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
E2F8A0AVK6 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
E2F8A0AVK6 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
E2F8A0AVK6 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
E2F8A0AVK6 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
E2F8A0AVK6 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
E2F8A0AVK6 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
E2F8A0AVK6 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
E2F8A0AVK6 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
E2F8A0AVK6 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
E2F8A0AVK6 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
E2F8A0AVK6 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
E2F8A0AVK6 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
E2F8A0AVK6 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
E2F8A0AVK6 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
E2F8A0AVK6 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
E2F8A0AVK6 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
E2F8A0AVK6 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
E2F8A0AVK6 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
E2F8A0AVK6 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms