Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 AC108751.3-201ENST00000461814 1020 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 IGLV3-24-201ENST00000517477 197 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 OR4A17P-201ENST00000526032 904 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 RGS5-218ENST00000526176 574 ntTSL 4 BASIC3.65□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 FOPNL-208ENST00000575744 565 ntTSL 4 BASIC3.65□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 AL591034.3-201ENST00000605511 685 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 CHD3-203ENST00000380358 7356 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 LTBP1-202ENST00000404525 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 AC004852.2-201ENST00000614289 2218 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 SCN4A-201ENST00000435607 7805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 NRXN1-242ENST00000635519 3553 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 GPR1-201ENST00000407325 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 DISP1-201ENST00000284476 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 FN1-206ENST00000359671 8524 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 MIR372-201ENST00000362225 67 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 MIR129-1-201ENST00000384972 72 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 CHEK2P3-201ENST00000416118 248 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 OR4K6P-201ENST00000416478 897 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 AL354766.1-201ENST00000423396 542 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 AC093581.1-201ENST00000446411 461 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 KNOP1P3-201ENST00000446933 426 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 AC013399.1-201ENST00000450311 418 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 BDNF-AS-201ENST00000499008 2324 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 AC021678.3-201ENST00000517893 476 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 AC022784.4-201ENST00000518589 422 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 OR8R1P-201ENST00000543943 764 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 LINC01269-201ENST00000553682 602 ntTSL 4 BASIC3.65□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 AC007179.3-201ENST00000604976 235 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 HNRNPU-219ENST00000639628 4546 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 TEP1-209ENST00000556935 7643 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 RAD51B-210ENST00000487270 2596 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 OR2A1-202ENST00000641044 4632 ntAPPRIS P1 BASIC3.65□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 EEF1A1P24-201ENST00000451469 1378 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 COPG2-201ENST00000330992 3073 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 BX284613.1-201ENST00000452221 1641 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 SLC2A14-218ENST00000543909 4125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 SERPINB4-201ENST00000341074 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 SUPT6H-201ENST00000314616 6523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 MYO5A-209ENST00000553916 5989 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 LRRC37B-204ENST00000543378 3091 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 CLEC3A-201ENST00000299642 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 C5orf24-201ENST00000338051 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 AL133216.2-201ENST00000622550 7213 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 ARHGEF7-208ENST00000426073 4921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 PTCD2P2-201ENST00000415579 1095 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 AL591719.2-201ENST00000437400 386 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 ARHGEF3-AS1-202ENST00000495939 336 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
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RYR3Q15413 SOX5-205ENST00000451604 4261 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
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RYR3Q15413 PECAM1-203ENST00000563924 6831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
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RYR3Q15413 AC114755.5-201ENST00000447760 831 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 PYDC2-201ENST00000518817 294 ntAPPRIS P1 BASIC3.64□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 AC138360.1-201ENST00000552332 386 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 AC098617.1-205ENST00000595918 1032 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 MAPK10-366ENST00000641903 2812 ntAPPRIS ALT1 BASIC3.64□□□□□ -1.83
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RYR3Q15413 SIPA1L2-203ENST00000366630 6690 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
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RYR3Q15413 MYEF2-202ENST00000324324 10360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 EMCN-201ENST00000296420 4037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 GCNA-201ENST00000373695 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 AL589993.1-201ENST00000407450 2524 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 NRCAM-204ENST00000379028 6685 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 RALGAPB-203ENST00000397042 8652 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 BTBD9-206ENST00000481247 8525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 SCARNA10-201ENST00000459255 330 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 LINC02451-201ENST00000546982 565 ntTSL 4 BASIC3.64□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 PDE4B-206ENST00000423207 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 KIAA2012-204ENST00000498697 3772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 KIAA0232-202ENST00000425103 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 DCAF1-203ENST00000504652 5951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 BIVM-ERCC5-201ENST00000602836 5143 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 NCKAP5-204ENST00000409213 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 AP005212.5-201ENST00000577614 3505 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 TNPO1P2-201ENST00000426249 2665 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 GPR87-201ENST00000260843 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 AL136981.1-203ENST00000451452 3844 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 5S_rRNA.1-201ENST00000364415 116 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 KRTAP19-8-201ENST00000382822 318 ntAPPRIS P1 BASIC3.64□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 TRAV8-7-201ENST00000390456 341 ntAPPRIS P1 BASIC3.64□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 RPS3AP12-201ENST00000443616 753 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
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