RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000402738.5

HERC3-202, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,974 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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HERC3-202ENST00000402738 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
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HERC3-202ENST00000402738 PPP4R2Q9NY27 417 aa13.07□□□□□ -0.32
HERC3-202ENST00000402738 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
HERC3-202ENST00000402738 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
HERC3-202ENST00000402738 BECN1Q14457 450 aa13.03□□□□□ -0.32
HERC3-202ENST00000402738 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa13.03□□□□□ -0.32
HERC3-202ENST00000402738 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa13.03□□□□□ -0.32
HERC3-202ENST00000402738 ARID3CA6NKF2 412 aa12.96□□□□□ -0.34
HERC3-202ENST00000402738 SLC24A1O60721 1099 aa12.95□□□□□ -0.34
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