Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA8

RCAN3, Calcipressin-3, humanhuman

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Length 241 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCAN3Q9UKA8 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RCAN3Q9UKA8 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RCAN3Q9UKA8 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RCAN3Q9UKA8 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RCAN3Q9UKA8 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RCAN3Q9UKA8 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RCAN3Q9UKA8 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RCAN3Q9UKA8 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RCAN3Q9UKA8 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RCAN3Q9UKA8 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RCAN3Q9UKA8 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RCAN3Q9UKA8 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RCAN3Q9UKA8 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RCAN3Q9UKA8 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RCAN3Q9UKA8 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RCAN3Q9UKA8 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
RCAN3Q9UKA8 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RCAN3Q9UKA8 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RCAN3Q9UKA8 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RCAN3Q9UKA8 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RCAN3Q9UKA8 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RCAN3Q9UKA8 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RCAN3Q9UKA8 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RCAN3Q9UKA8 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RCAN3Q9UKA8 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RCAN3Q9UKA8 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RCAN3Q9UKA8 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RCAN3Q9UKA8 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RCAN3Q9UKA8 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RCAN3Q9UKA8 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RCAN3Q9UKA8 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RCAN3Q9UKA8 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RCAN3Q9UKA8 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RCAN3Q9UKA8 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RCAN3Q9UKA8 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RCAN3Q9UKA8 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
RCAN3Q9UKA8 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RCAN3Q9UKA8 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RCAN3Q9UKA8 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RCAN3Q9UKA8 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RCAN3Q9UKA8 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RCAN3Q9UKA8 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RCAN3Q9UKA8 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RCAN3Q9UKA8 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RCAN3Q9UKA8 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RCAN3Q9UKA8 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RCAN3Q9UKA8 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RCAN3Q9UKA8 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RCAN3Q9UKA8 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
RCAN3Q9UKA8 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RCAN3Q9UKA8 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RCAN3Q9UKA8 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RCAN3Q9UKA8 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
RCAN3Q9UKA8 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RCAN3Q9UKA8 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RCAN3Q9UKA8 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RCAN3Q9UKA8 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RCAN3Q9UKA8 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RCAN3Q9UKA8 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RCAN3Q9UKA8 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RCAN3Q9UKA8 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RCAN3Q9UKA8 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RCAN3Q9UKA8 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RCAN3Q9UKA8 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RCAN3Q9UKA8 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RCAN3Q9UKA8 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RCAN3Q9UKA8 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RCAN3Q9UKA8 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RCAN3Q9UKA8 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RCAN3Q9UKA8 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RCAN3Q9UKA8 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RCAN3Q9UKA8 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RCAN3Q9UKA8 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RCAN3Q9UKA8 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RCAN3Q9UKA8 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RCAN3Q9UKA8 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RCAN3Q9UKA8 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RCAN3Q9UKA8 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RCAN3Q9UKA8 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RCAN3Q9UKA8 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RCAN3Q9UKA8 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RCAN3Q9UKA8 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RCAN3Q9UKA8 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RCAN3Q9UKA8 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
RCAN3Q9UKA8 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RCAN3Q9UKA8 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RCAN3Q9UKA8 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
RCAN3Q9UKA8 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RCAN3Q9UKA8 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RCAN3Q9UKA8 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RCAN3Q9UKA8 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RCAN3Q9UKA8 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RCAN3Q9UKA8 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RCAN3Q9UKA8 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RCAN3Q9UKA8 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RCAN3Q9UKA8 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RCAN3Q9UKA8 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RCAN3Q9UKA8 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RCAN3Q9UKA8 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RCAN3Q9UKA8 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
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