Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB5

MBD2, Methyl-CpG-binding domain protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD2Q9UBB5 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MBD2Q9UBB5 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MBD2Q9UBB5 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MBD2Q9UBB5 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MBD2Q9UBB5 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MBD2Q9UBB5 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MBD2Q9UBB5 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MBD2Q9UBB5 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MBD2Q9UBB5 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MBD2Q9UBB5 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MBD2Q9UBB5 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MBD2Q9UBB5 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MBD2Q9UBB5 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MBD2Q9UBB5 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MBD2Q9UBB5 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MBD2Q9UBB5 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MBD2Q9UBB5 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MBD2Q9UBB5 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MBD2Q9UBB5 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MBD2Q9UBB5 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MBD2Q9UBB5 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MBD2Q9UBB5 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MBD2Q9UBB5 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MBD2Q9UBB5 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MBD2Q9UBB5 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MBD2Q9UBB5 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MBD2Q9UBB5 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MBD2Q9UBB5 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MBD2Q9UBB5 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MBD2Q9UBB5 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MBD2Q9UBB5 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MBD2Q9UBB5 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MBD2Q9UBB5 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MBD2Q9UBB5 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MBD2Q9UBB5 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MBD2Q9UBB5 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MBD2Q9UBB5 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
MBD2Q9UBB5 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MBD2Q9UBB5 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MBD2Q9UBB5 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MBD2Q9UBB5 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MBD2Q9UBB5 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MBD2Q9UBB5 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MBD2Q9UBB5 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MBD2Q9UBB5 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MBD2Q9UBB5 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MBD2Q9UBB5 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MBD2Q9UBB5 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MBD2Q9UBB5 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MBD2Q9UBB5 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MBD2Q9UBB5 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MBD2Q9UBB5 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
MBD2Q9UBB5 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MBD2Q9UBB5 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MBD2Q9UBB5 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MBD2Q9UBB5 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MBD2Q9UBB5 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MBD2Q9UBB5 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MBD2Q9UBB5 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MBD2Q9UBB5 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MBD2Q9UBB5 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MBD2Q9UBB5 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MBD2Q9UBB5 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MBD2Q9UBB5 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MBD2Q9UBB5 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MBD2Q9UBB5 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MBD2Q9UBB5 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MBD2Q9UBB5 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MBD2Q9UBB5 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MBD2Q9UBB5 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MBD2Q9UBB5 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MBD2Q9UBB5 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MBD2Q9UBB5 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MBD2Q9UBB5 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MBD2Q9UBB5 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MBD2Q9UBB5 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
MBD2Q9UBB5 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
MBD2Q9UBB5 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
MBD2Q9UBB5 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
MBD2Q9UBB5 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.22
MBD2Q9UBB5 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MBD2Q9UBB5 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MBD2Q9UBB5 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MBD2Q9UBB5 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MBD2Q9UBB5 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MBD2Q9UBB5 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MBD2Q9UBB5 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MBD2Q9UBB5 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MBD2Q9UBB5 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MBD2Q9UBB5 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MBD2Q9UBB5 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MBD2Q9UBB5 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MBD2Q9UBB5 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MBD2Q9UBB5 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MBD2Q9UBB5 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MBD2Q9UBB5 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MBD2Q9UBB5 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MBD2Q9UBB5 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MBD2Q9UBB5 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MBD2Q9UBB5 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms