Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP72

RAB18, Ras-related protein Rab-18, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB18Q9NP72 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB18Q9NP72 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB18Q9NP72 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB18Q9NP72 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB18Q9NP72 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB18Q9NP72 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB18Q9NP72 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB18Q9NP72 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB18Q9NP72 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB18Q9NP72 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB18Q9NP72 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB18Q9NP72 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB18Q9NP72 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB18Q9NP72 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB18Q9NP72 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB18Q9NP72 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB18Q9NP72 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB18Q9NP72 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB18Q9NP72 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB18Q9NP72 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB18Q9NP72 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB18Q9NP72 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB18Q9NP72 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB18Q9NP72 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB18Q9NP72 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB18Q9NP72 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB18Q9NP72 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB18Q9NP72 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB18Q9NP72 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB18Q9NP72 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB18Q9NP72 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB18Q9NP72 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB18Q9NP72 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB18Q9NP72 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB18Q9NP72 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB18Q9NP72 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB18Q9NP72 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB18Q9NP72 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB18Q9NP72 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB18Q9NP72 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB18Q9NP72 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB18Q9NP72 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB18Q9NP72 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB18Q9NP72 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB18Q9NP72 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB18Q9NP72 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB18Q9NP72 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB18Q9NP72 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB18Q9NP72 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB18Q9NP72 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB18Q9NP72 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB18Q9NP72 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB18Q9NP72 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB18Q9NP72 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB18Q9NP72 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB18Q9NP72 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB18Q9NP72 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB18Q9NP72 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB18Q9NP72 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB18Q9NP72 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB18Q9NP72 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB18Q9NP72 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB18Q9NP72 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB18Q9NP72 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB18Q9NP72 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB18Q9NP72 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB18Q9NP72 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB18Q9NP72 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB18Q9NP72 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB18Q9NP72 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB18Q9NP72 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB18Q9NP72 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB18Q9NP72 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB18Q9NP72 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB18Q9NP72 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB18Q9NP72 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB18Q9NP72 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB18Q9NP72 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB18Q9NP72 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB18Q9NP72 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB18Q9NP72 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB18Q9NP72 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB18Q9NP72 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB18Q9NP72 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB18Q9NP72 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB18Q9NP72 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB18Q9NP72 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB18Q9NP72 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB18Q9NP72 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB18Q9NP72 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB18Q9NP72 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB18Q9NP72 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB18Q9NP72 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB18Q9NP72 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB18Q9NP72 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB18Q9NP72 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB18Q9NP72 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB18Q9NP72 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB18Q9NP72 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB18Q9NP72 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms