Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRU9

UTP23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP23Q9BRU9 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UTP23Q9BRU9 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UTP23Q9BRU9 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UTP23Q9BRU9 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UTP23Q9BRU9 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UTP23Q9BRU9 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UTP23Q9BRU9 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UTP23Q9BRU9 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UTP23Q9BRU9 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UTP23Q9BRU9 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UTP23Q9BRU9 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UTP23Q9BRU9 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UTP23Q9BRU9 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
UTP23Q9BRU9 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UTP23Q9BRU9 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UTP23Q9BRU9 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UTP23Q9BRU9 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UTP23Q9BRU9 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UTP23Q9BRU9 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
UTP23Q9BRU9 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UTP23Q9BRU9 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UTP23Q9BRU9 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UTP23Q9BRU9 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UTP23Q9BRU9 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UTP23Q9BRU9 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UTP23Q9BRU9 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UTP23Q9BRU9 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UTP23Q9BRU9 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UTP23Q9BRU9 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UTP23Q9BRU9 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UTP23Q9BRU9 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UTP23Q9BRU9 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UTP23Q9BRU9 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UTP23Q9BRU9 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UTP23Q9BRU9 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UTP23Q9BRU9 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UTP23Q9BRU9 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UTP23Q9BRU9 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UTP23Q9BRU9 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UTP23Q9BRU9 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UTP23Q9BRU9 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UTP23Q9BRU9 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UTP23Q9BRU9 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UTP23Q9BRU9 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UTP23Q9BRU9 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UTP23Q9BRU9 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UTP23Q9BRU9 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UTP23Q9BRU9 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UTP23Q9BRU9 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UTP23Q9BRU9 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UTP23Q9BRU9 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UTP23Q9BRU9 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UTP23Q9BRU9 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UTP23Q9BRU9 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UTP23Q9BRU9 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UTP23Q9BRU9 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UTP23Q9BRU9 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UTP23Q9BRU9 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UTP23Q9BRU9 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UTP23Q9BRU9 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UTP23Q9BRU9 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UTP23Q9BRU9 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UTP23Q9BRU9 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UTP23Q9BRU9 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UTP23Q9BRU9 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UTP23Q9BRU9 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UTP23Q9BRU9 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UTP23Q9BRU9 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UTP23Q9BRU9 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UTP23Q9BRU9 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UTP23Q9BRU9 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UTP23Q9BRU9 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UTP23Q9BRU9 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
UTP23Q9BRU9 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UTP23Q9BRU9 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UTP23Q9BRU9 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UTP23Q9BRU9 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UTP23Q9BRU9 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UTP23Q9BRU9 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UTP23Q9BRU9 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UTP23Q9BRU9 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UTP23Q9BRU9 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UTP23Q9BRU9 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UTP23Q9BRU9 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UTP23Q9BRU9 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UTP23Q9BRU9 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UTP23Q9BRU9 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UTP23Q9BRU9 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UTP23Q9BRU9 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UTP23Q9BRU9 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UTP23Q9BRU9 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UTP23Q9BRU9 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UTP23Q9BRU9 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UTP23Q9BRU9 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UTP23Q9BRU9 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UTP23Q9BRU9 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UTP23Q9BRU9 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UTP23Q9BRU9 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UTP23Q9BRU9 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UTP23Q9BRU9 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms