Protein–RNA interactions for Protein: Q96MU7

YTHDC1, YTH domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDC1Q96MU7 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
YTHDC1Q96MU7 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
YTHDC1Q96MU7 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
YTHDC1Q96MU7 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
YTHDC1Q96MU7 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
YTHDC1Q96MU7 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
YTHDC1Q96MU7 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
YTHDC1Q96MU7 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
YTHDC1Q96MU7 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
YTHDC1Q96MU7 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
YTHDC1Q96MU7 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
YTHDC1Q96MU7 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
YTHDC1Q96MU7 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
YTHDC1Q96MU7 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
YTHDC1Q96MU7 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
YTHDC1Q96MU7 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
YTHDC1Q96MU7 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
YTHDC1Q96MU7 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
YTHDC1Q96MU7 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
YTHDC1Q96MU7 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
YTHDC1Q96MU7 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
YTHDC1Q96MU7 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
YTHDC1Q96MU7 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
YTHDC1Q96MU7 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
YTHDC1Q96MU7 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
YTHDC1Q96MU7 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
YTHDC1Q96MU7 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
YTHDC1Q96MU7 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
YTHDC1Q96MU7 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
YTHDC1Q96MU7 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
YTHDC1Q96MU7 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
YTHDC1Q96MU7 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
YTHDC1Q96MU7 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
YTHDC1Q96MU7 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
YTHDC1Q96MU7 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
YTHDC1Q96MU7 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
YTHDC1Q96MU7 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
YTHDC1Q96MU7 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
YTHDC1Q96MU7 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
YTHDC1Q96MU7 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
YTHDC1Q96MU7 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
YTHDC1Q96MU7 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
YTHDC1Q96MU7 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
YTHDC1Q96MU7 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
YTHDC1Q96MU7 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
YTHDC1Q96MU7 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
YTHDC1Q96MU7 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
YTHDC1Q96MU7 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
YTHDC1Q96MU7 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
YTHDC1Q96MU7 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
YTHDC1Q96MU7 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
YTHDC1Q96MU7 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
YTHDC1Q96MU7 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
YTHDC1Q96MU7 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
YTHDC1Q96MU7 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
YTHDC1Q96MU7 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
YTHDC1Q96MU7 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
YTHDC1Q96MU7 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
YTHDC1Q96MU7 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
YTHDC1Q96MU7 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
YTHDC1Q96MU7 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
YTHDC1Q96MU7 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
YTHDC1Q96MU7 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
YTHDC1Q96MU7 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
YTHDC1Q96MU7 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
YTHDC1Q96MU7 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
YTHDC1Q96MU7 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
YTHDC1Q96MU7 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
YTHDC1Q96MU7 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
YTHDC1Q96MU7 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
YTHDC1Q96MU7 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
YTHDC1Q96MU7 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
YTHDC1Q96MU7 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
YTHDC1Q96MU7 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
YTHDC1Q96MU7 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
YTHDC1Q96MU7 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
YTHDC1Q96MU7 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
YTHDC1Q96MU7 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
YTHDC1Q96MU7 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
YTHDC1Q96MU7 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.93
YTHDC1Q96MU7 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
YTHDC1Q96MU7 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
YTHDC1Q96MU7 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
YTHDC1Q96MU7 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
YTHDC1Q96MU7 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
YTHDC1Q96MU7 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
YTHDC1Q96MU7 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
YTHDC1Q96MU7 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
YTHDC1Q96MU7 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
YTHDC1Q96MU7 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
YTHDC1Q96MU7 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
YTHDC1Q96MU7 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
YTHDC1Q96MU7 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
YTHDC1Q96MU7 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
YTHDC1Q96MU7 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
YTHDC1Q96MU7 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
YTHDC1Q96MU7 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
YTHDC1Q96MU7 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
YTHDC1Q96MU7 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
YTHDC1Q96MU7 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms